Тут живе ваш мікробіом - MyMicrobiome
Сечостатеві шляхи - це неймовірно вибаглива ділянка тіла, коли мова йде про його мешканців. Піхвовий мікробіом надзвичайно спеціалізований, що дозволяє там жити лише деяким видам бактерій. Хоча мікробне різноманіття тут дуже низьке порівняно з іншими частинами тіла, це дуже унікальна екосистема у людей, завдання якої - підтримувати рН в потрібному діапазоні та не давати ворогам не потрапляти. Бактерія, яка любить там жити, належить до виду Lactobacillus. У більшості жінок є одна з 5 різних мікробних спільнот, у кожній з яких переважає вид лактобактерій (L. crispatus, L. iners, L. jensenii або L. gasseri). Вивільняючи молочну кислоту та хімічну зброю (H2O2 та бактеріозин), Lactobacillus запобігає колонізації шкідливих організмів, таких як дріжджі або патогенні бактерії.

Шкіра площею 1,8 м 2 набагато складніша, оскільки охоплює дуже різні ландшафти, кожен з яких має унікальну екосистему.
Так звані пустельні ділянки шкіри (суха шкіра, така як сідниці, передпліччя або різні ділянки кисті) вміщують найбільше мікробне різноманіття з 19 різними бактеріальними відділами, чотири з яких є домінуючими (Actinobacteria (52%), Firmicutes (24%), Proteobacteria (17) %) та Bacteroidetes (7%)). Тут є навіть грамнегативні бактерії, які спочатку вважали забруднювачами з травного тракту. Цікаво, що філогенетичне різноманіття бактерій більше на сухій шкірі, ніж у роті та травному тракті тієї самої людини.
Жирні ділянки шкіри (ділянки шкірного сала, такі як лоб, за вухом, спиною та ніздрями) переважно колонізуються пропіонібактеріями. Ці бактерії, як правило, нешкідливі, просто захищаючись від ворожих поселенців. Однак настання статевого дозрівання призводить до того, що гормональні зміни змінюють хімічне середовище на шкірі, особливо на обличчі. Ці зміни призводять до боротьби між імунною системою та пропіонібактеріями, яка проявляється в заражених сальних залозах і, отже, вуграх.
Вологі джунглі шкіри (вологі ділянки, такі як пупок, пахва, сідниці, підошви ніг, коліна та пахви) є домом для коринебактерій та стафілококів. Незважаючи на те, що мікробна різноманітність нижча у вологих районах порівняно з сухими ділянками шкіри, тут щільність бактерій найвища - понад 15 мільйонів бактерій у районі розміром з поштову марку.
Дуже важливим воїном шкіри є Staphylococcus epidermidis, який активно працює з імунною системою шкіри, утримуючи патогенні бактерії (наприклад, Staphylocuccus aureus). Як і у всіх екосистемах нашого організму, порушення цього симбіозу може спричинити захворювання. Добре відомими прикладами такого дисбіозу є шкірні захворювання атопічний дерматит, вульгарні вугрі та хронічні рани.
Рот знаходиться біля входу в шлунково-кишковий тракт. Вже тут мешкає близько 6 мільйонів мікроорганізмів, які можна класифікувати на 4 основні підрозділи (Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria і Fusobacteria). Тут бактерії осідають у слизовій порожнини рота, на зубах та на мові; кожна область - це своя екосистема зі своїм відмінним різноманіттям. В цілому в роті переважає один вид бактерій: стрептокок.
Через високий вміст кислоти шлунок приймає лише бактеріальні популяції з низьким розмаїттям. В основному він складається з актинобактерій та хелікобактерів (наприклад, H. pylori). На додаток до регулювання кислотності в шлунку, H. pylori регулює виділення гормону греліну, який бере участь у регуляції апетиту. Якщо ця бактерія відсутня, збільшується вироблення греліну і, отже, більший апетит.
На жаль, за останні кілька десятиліть H. pylori мав погану репутацію як причина виразкової хвороби шлунка у сприйнятливих осіб; бактерія була майже повністю ліквідована в наших шлунках за допомогою антибіотиків, що пояснює підвищений рівень ожиріння у дітей, особливо в США.
Якщо ми йдемо далі до тонкої кишки і далі до товстої кишки, кількість бактерій різко зростає, чим далі ми йдемо. У нашому кишечнику живе в мільйони разів більше бактерій, ніж на шкірі чи в роті. Насправді кишкової стінки не видно, оскільки вона вкрита килимом бактерій.
У мікробіомі кишечника переважають бактерії двох філогенетичних груп - Bacteroidetes і Firmicutes. Співвідношення цих груп бактерій між собою дуже різниться від людини до людини і відіграє дуже важливу роль при ожирінні. Більша частка Firmicuten порівняно з Bacteroides у кишечнику пов’язана з ожирінням.
Окрім здатності використовувати більшу чи меншу кількість енергії з їжі, кишковий мікробіом виконує інші дуже важливі для нас функції. З одного боку, це метаболічна діяльність, така як синтез вітамінів, розпад хімічних речовин та поживних речовин та підтримка жирового обміну. З іншого боку, це взаємодія з нашою імунною системою. Наш мікробіом конкурує з шкідливими бактеріями за поживні речовини та простір поселення, а також бореться із шкідливими загарбниками хімічною зброєю. Мікробіом також стимулює нашу імунну систему дозрівати.