Covid-19 слід мікробіоти, до нової парадигми

Ви будете в курсі статей, що з’являються на цю тему

Щоб додати цей елемент до улюбленого, увійдіть.

Превотелла бактерії, іноді є причиною респіраторних інфекцій

Оскільки будь-яка війна дозволяє досягти сліпучого науково-технічного прогресу, можна впевнено стверджувати, що ця глобальна пандемія, а також наукова мобілізація, що супроводжує її, навчать нас багато чому про імунну систему і, оскільки вона зараз невіддільна від неї, про мікробіоти.

Мільярди бактерій, які ми зберігаємо, мають вирішальне значення для нашого імунного захисту, ми це вже знали. Але природа взаємодії, яку вони мають між собою, а також з вірусами, ніколи не перестає дивувати. Щойно випущені дослідження коронавірусу вже показують участь дуже специфічних бактерій, що передбачає терапевтичні осі, але також і профілактику.

Не дивно, що в цьому задіяна екосистема кишечника

Зрозумійте інвазивний процес ГРВІ-COV-2 є критичною точкою, і аналіз профілю експресії генів рецепторів коронавірусу може допомогти. Ми знаємо, що ці рецептори (ворота для проникнення вірусу в організм, як АСЕ2) - це ферменти, пов’язані з клітинами кишечника. Коронавіруси постійно змінюють свою схему зв'язування, коли вони еволюціонують, і потенційна мішень у легенях також змінюється, але не в тонкому кишечнику, де вона залишається постійною. Отже, клітини слизової оболонки кишечника (ентероцити) можуть становити резервуар для коронавірусів . Однак ці рецептори можуть бути більше у разі надлишку несимбіотичних бактерій. (1)

Китайські дослідники дивились на це зміни мікробіоти у пацієнтів найбільш постраждалих (тих, хто помер). Виявлено секвенування мікробіоти значне зниження біфідо- та лактобактерій, основні сімейства симбіотичних бактерій, а також збільшення кількості умовно-патогенних бактерій, таких як Corynebacterium або Ruthenibacterium. Ступінь тяжкості гіпоксемії (нестача кисню, що переноситься в крові) суттєво корелювала з підвищеним рівнем імунних клітин та маркерами запалення. (2) Помилковий цикл між гіпер-запаленням та дисбактеріозом кишечника представляє високий ризик дихання фатальний. У гострій фазі ДНК вірусу в крові була виявлена лише у 10% пацієнтів, але у 50% з них вона все ще була виявлена в калі. Там навіть кілька разів ідентифікували живий вірус, що припускає це стілець може бути способом зараження.

Ми знаємо, що кишкова імунна система (GALT) задає тон загальній імунній реакції у всіх нас, як це робить мікробіота кишечника та мікробіота легенів взаємопов’язані навіть на відстані. Ліпополісахариди (ЛПС), молекули, що виробляються грамнегативними бактеріями, створюють прозапальний клімат у всьому тілі. Особи, чиї імунна система реагує занадто багато або занадто мало, більшу частину часу порушена кишкова екосистема, з аномальним розподілом мікробних сімей, надмірною проникністю слизової оболонки та схильністю до систематичного запалення. Їжа, спосіб життя та довкілля чітко задіяні.

Люди похилого віку не тільки недоїдають. Вони також мають більш незбалансовану мікробіоти, який тяжіє до системного запалення. Тому зрозуміло, чому це населення платить найвищу ціну за вірусні атаки. Численні дослідження показали, що мікробіота людей похилого віку має більше грамнегативних бактерій, що призводить до підвищення рівня ЛПС, а отже, проникності кишечника та ризику запалення.

Бактерії, заражені вірусом ?

Генетичне секвенування мікробіоти кількох пацієнтів в Ухані (китайському місті, де почалася епідемія) виявило дуже дивні явища, аж до того, що дослідники вперше задумались, чи не допустили вони помилок. Здавалося, бактерії роду Prevotella містять ДНК вірусу SARS-COV-2, ніби вірус заразив бактерії. (3) Незадовго до цього, послідовність мікробіоти шести тяжко інфікованих пацієнтів з тієї ж родини в Гонконзі показала значну кількість превотелли в їх калі. Ці спостереження дозволяють припустити, що SARS-COV-2 поводився б як бактеріофаг, вірус, який інфікує бактерії. (4.1)

[Ініціатор гіпотези, Сандіп Чаркраборті, молодий індійський дослідник обчислювальної біології, відтоді відмовився від цього питання. Дійсно, фактичні елементи, які могли б це підтвердити, остаточно не з'явилися. Але він підтримує свою гіпотезу про причетність превотелли в етіології COVID-19]. (M.A.J 28/04/2020)

Ось чим можна пояснити великі зміни вірусного навантаження від тесту до тесту у однієї і тієї ж людини, ніби вірус десь ховався (4.2). Гіпотеза, яка з’являється, полягає в тому, що вірус заражає бактерії, які потім стають вірулентними, викликаючи, зокрема, іноді смертельне запалення. Петля стягується, коли ми це дізнаємось Вже відомо, що інфекції, що залучають Превотеллу, викликають респіраторні симптоми, включаючи гострі. (5)

У Франції вчитель науки розпочав спробу демонстрації, яка могла б пройти надумано, якби вона не була задокументована. (6) Він піднімає той факт, що діти, які дуже мало постраждали від епідемії, мають бідну мікробіоту в Превотеллі. У зрілому віці цей рід бактерій, який є частиною коменсальної флори, стає набагато більш представленим. Більше серед жінок, ніж серед чоловіків, тоді як статистика свідчить, що Covid-19 менше страждає від жінок. У цій гіпотезі їх імунна система була б більш звикла тримати Превотеллу в руці. Послідовність мікробіоти на більших зразках популяції дозволить нам з’ясувати, чи правильно це. Це, до речі, свідчить про зацікавленість наукової роботи, яка дозволяє не дослідникам, іноді простим пристрасним громадянам, порушувати обґрунтовані питання. Якщо виявиться, що Covid-19 справді є змішаною інфекцією - як вірусною, так і бактеріальною - тоді користь поєднання гідроксихлорохіну та антибіотика азитроміцину, освячений професором Дідьє Раулем, набуває повного значення. Зокрема, азитроміцин активний на превотеллу та на внутрішньоклітинні мікроби.

Пробіотики можуть допомогти

В управлінні Covid-19 створений Медичний університет Чжецзян, який має хороші результати, так звана стратегія "чотири проти і дві рівноваги": противірусний, протиударний, антигіпоксемічний, протиінфекційний, підтримка електролітного балансу та мікробіотичного балансу. До кожного застосовували мультидисциплінарне та індивідуальне лікування для посилення терапевтичного ефекту. Тривога і страх, дуже присутні у людей із Covid-19, супроводжувались традиційною китайською медициною.

У кількох пацієнтів спостерігався дисбактеріоз кишечника із помітним зменшенням кількості біфідо- та лактобактерій. A підтримка мікроелементів для кишечника пропонується всім, із застосуванням пробіотиків та пребіотиків, для відновлення балансу та запобігання ризику вторинної інфекції. (7) Антибіотикотерапія була зарезервована для людей з тривалим перебігом хвороби та повторною лихоманкою.

Штам Lactobacillus plantarum, діючи на кишковий слиз, має допомогло запобігти коронавірусної інфекції епітеліальних клітин у дослідженні на тваринних моделях. (8) При хронічних запальних захворюваннях прийом всередину пробіотичного комплексу з високою концентрацією додатково знижує рівні прозапальних цитокінів у плазмі крові та підвищує рівень цитокінів, що регулюють запалення, із змінами мікробіоти фекалій порівняно з контрольною групою. (9) Інший комплекс, який використовує Lactobacillus brevis як домінантний штам, дає подібні результати, але діє на вісь кишечника та мозку через імунний, метаболічний та нервовий шляхи. (10) Деталь, і не в останню чергу, полягає в тому, що Lactobacillus brevis є здатний запобігти Превотелла для формування біоплівки. (11) Але ці біоплівки є одним із засобів, що використовуються бактеріями для захисту від імунної системи та антибіотиків.

Нарешті, люди з ожирінням, які більше страждають від Covid-19, мають часто незбалансовану мікробіоту, багатшу в Превотеллі. Якщо введення пробіотиків цій популяції дає хороші результати з точки зору поліпшення маркерів ожиріння (жирова маса, глікемія, інсулін тощо), ці результати ще більш помітні для осіб, у яких бактерії були дуже присутніми. (12)

Поводження мікробних популяцій, що колонізують людський організм, продовжує вивчатися, зокрема для виявлення та розуміння відмінностей між категоріями людей, що перебувають у групі ризику, та тими, хто залишається здоровим. Якщо пошук лікування Covid-19 йде повним ходом, кращі знання про взаємодію між господарем, бактеріями та вірусом могли б направити зусилля рішуче. У цій галузі ми перебуваємо в розпалі епохи новаторства. Пробіотики нового покоління представляють цікаві можливості для профілактики та ад'ювантного лікування.