Профілі мікробів ентеросанова лабораторна діагностика - діагностика стільця та вагінальна діагностика

Мікробні профілі

«Хто є хто» кишкових мікробів

Тут ви знайдете короткі описи кишкових мікробів, які можна регулярно діагностувати за допомогою стільця. Розрізняють дві групи:

Зовнішні кишкові мікроби = Представник нормальної флори кишечника
Пасивні мікроби = «Сторонні» мікроби, які потрапляють у кишечник із зовнішнього світу. Їм заважають оселитися в здоровому кишечнику. Їх підвищену частоту трактування слід інтерпретувати як ознаку порушення кишкового бар’єру.

Кишкова паличка

Кишкова паличка, безумовно, є найвідомішою та найбільш вивченою бактерією у світі. Однак у кишечнику він становить менше 0,1% місцевої флори.

Кишкова паличка є однією з обов’язкових флор товстого кишечника у людей та багатьох тварин.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Обов’язковий кишковий зародок.
Споживання кисню в кишечнику, тим самим відкриваючи шлях анаеробним бактеріям.
Захист від чужорідних мікробів шляхом виробництва коротколанцюгових жирних кислот та коліцинів (= мікробіцидні білки).
Тренування імунної системи, пов’язаної з кишечником.

Метаболічний спектр:

Бродіння вуглеводів з утворенням коротколанцюгових жирних кислот та газоподібних метаболітів (водню та діоксиду вуглецю).
Споживання кисню в кишечнику, тим самим відкриваючи шлях анаеробним бактеріям.

Варіанти кишкової палички

Варіанти кишкової палички за своєю метаболічною поведінкою відрізняються від представників резидентної флори. У звичайній бактеріологічній діагностиці можна легко продемонструвати два варіанти обміну речовин:

А. Лактозонегативні варіанти кишкової палички

Ці штами не можуть використовувати цукор-лактозу. Виявлення відбувається на культуральних середовищах, що містять лактозу.
Важливо: Докази не пов’язані з непереносимістю лактози організмом господаря!

B. Варіанти гемолітичної кишкової палички

Ці штами можуть лізувати еритроцити. Докази засновані на гемолізі на кровоносних поживних середовищах.

Варіанти кишкової палички трапляються як транзиторні мікроби після перорального прийому з їжею тимчасово та з низькою кількістю мікробів навіть у здорових кишках.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Пасивні мікроби.
Не патогенний сам по собі, але не доведено позитивних ефектів.
Кількість бактерій понад 10 5 КУО/г стільця свідчить про порушення стійкості до колонізації. Часто пов’язане з надлишком білків у кишечнику (недоїдання, порушення травлення, запалення слизових оболонок).
Не слід ототожнювати з ентеропатогенною кишковою паличкою (наприклад, EHEC). Їх виявлення вимагає спеціальної діагностики.

Метаболічний спектр:

В основному використання білків. Виробництво аміаку (алкалізація стільця) та різних біогенних амінів (гістамін, путресцин, тирамін тощо).

Інші ентеробактерії

Окрім кишкової палички, в калі можна виявити інших представників сімейства Enterobacteriaceae, яке наразі налічує близько 80 видів. Зокрема, Klebsiella spp., Proteus spp., Enterobacter spp. та Citrobacter spp. на.

Klebsiella spp., Proteus spp., Enterobacter spp. та Citrobacter spp. поширені в навколишньому середовищі, особливо в ґрунті, воді та на рослинних матеріалах.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Пасивні мікроби.
Не доведено позитивних наслідків для екології кишечника.
Кількість бактерій у стільці вище 10 5 КУО/г стільця свідчить про порушення стійкості до колонізації або недостатнє харчування (високий вміст білка) або травну недостатність (порушення перетравлення білка).
Виявлення Klebsiella, Enterobacter та Citrobacter в калі людей, які харчуються сирою їжею, можливо, "нормальні результати". Ці мікроби належать до нормальної флори багатьох рослин.

Метаболічний спектр:

В основному утилізація білків з утворенням аміаку (підщелачення стільця) та біогенних амінів (наприклад, кадаверин та путресцин).

Enterococcus spp.

Ентерококи є частиною обов’язкової флори тонкої і товстої кишок.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Зовнішні кишкові мікроби.
Захист від транзиторних мікробів шляхом утворення мікробіцидних речовин, таких як коротколанцюгові жирні кислоти, перекис водню та різні бактеріоцини (ентероцини).

Метаболічний спектр:

Переважно вуглеводний оборот з виробництвом коротколанцюгових жирних кислот (наприклад, оцтової, пропіонової та молочної кислот). Вони підкислюють кишкове середовище, стимулюють приплив крові до слизової оболонки кишечника та перистальтику кишечника та покривають 40-50% енергетичних потреб епітеліальних клітин товстої кишки. Крім того, вони також мають прямий антагоністичний вплив на різні перехідні мікроби.

Інші аеробні бактерії

Представники родів Pseudomonas, Bacillus, Staphylococcus і Streptococcus також рідше зустрічаються в калі.

широко розповсюджена колонізація різних екологічних матеріалів (Pseudomonas spp., Bacillus spp.)

Частина місцевої флори шкіри та верхніх дихальних шляхів людини та тварин (Staphylococcus spp., Streptococcus spp.).

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Пасивні мікроби.
Немає відомих сприятливих ефектів на кишкову екосистему.
Кількість бактерій понад 10 4 КУО/г калу слід інтерпретувати як ознаку порушення стійкості до колонізації.
Деякі види родів Pseudomonas, Staphylococcus та Bacillus також можуть викликати діарею.
ß-гемолітичні стрептококи виділяють зі стільця переважно у випадку проктологічних проблем (гемороїдальні ускладнення, тріщини заднього проходу, свищі) або джерела інфекції в області ЛОР (наприклад, тонзиліт, синусит).

Метаболічний спектр:

У Pseudomonas spp. і Bacillus spp. Основна увага приділяється утилізації білків.
Стафілококи та стрептококи, як правило, не особливо очевидні з точки зору їх метаболічної активності.

Bacteroides spp.

Для простоти представники трьох обов'язково анаеробних родів, тобто Bacteroides, Prevotella та Porphyromonas, які ростуть лише за винятком кисню, часто під мікроекологічною процедурою підпадають під стару загальну назву "Bacteroides".

Bacteroides spp., Prevotella spp. та Porphyromonas spp. зв’язані з теплокровними організмами і є частиною флори товстої кишки та сечостатевих шляхів.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Обов’язкові кишкові мікроби, основний компонент обов’язкової флори товстої кишки.

Метаболічний спектр:

Порівняно невелика метаболічна активність.
Крім утилізації вуглеводів, особливо оборот білків.
Деякі представники можуть синтезувати з жовчних кислот так звані фекапентаєни. Деякі з них виявились мутагенними (мутагенними).

Clostridium spp.

Клостридії - це мікроби, які ростуть анаеробно, тобто вони ростуть лише за відсутності кисню. Завдяки утворенню постійних форм (спор) вони надзвичайно стійкі до несприятливих впливів навколишнього середовища. Серед клостридій є кілька важливих збудників:

Clostridioides difficile як збудник антибіотико-асоційованого коліту (AAC).

Clostridium perfringens, як збудник токсичних інфекцій (серед іншого причина харчових отруєнь). Однак їх запис вимагає спеціальних процедур перевірки.

Інші патогенні представники цього роду, як збудники інтоксикацій (Cl. Botulinum), токсичних інфекцій (Cl. Tetani) та інфекційних захворювань (Cl. Chauvoei, Cl. Septicum, Cl. Novyi), переважно не мають клінічного значення в кишковому каналі людини.

Природне розташування клостридій знаходиться в товстому кишечнику людей і тварин, а також у навколишньому середовищі (ґрунті).

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Обов’язкові мікроби товстої кишки, але без задокументованої позитивної активності в екології кишечника.

Метаболічний спектр:

Білки та жири є основними субстратами клостридій. Окрім аміаку, сірководню та біогенних амінів утворюються також стероїдні сполуки, які, як було доведено, діють як ко-канцерогени при розвитку карцином товстої кишки та молочної залози.
Деякі Clostridia spp. також здатні трансформувати стероїдне ядро жовчних кислот (NDH-Clostridia = Nuclear Dehyrogenating-Clostridia). Отримані метаболіти також можуть брати участь у канцерогенезі товстої кишки.

Bifidobacterium spp.

Біфідобактерії є анаеробами, тобто вони ростуть лише за відсутності кисню.

Біфідобактерії є частиною обов’язкової флори тонкої та товстої кишок, ротової порожнини та піхви.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Зовнішні кишкові мікроби.
Основний компонент кишкової флори немовляти.
Захист від чужорідних мікробів, особливо за рахунок виробництва коротколанцюгових жирних кислот.

Метаболічний спектр:

Виключне використання вуглеводів, особливо клітковини в кишечнику. Виробництво коротколанцюгових жирних кислот, особливо оцтової та, меншою мірою, молочної кислоти без утворення газів.

Lactobacillus spp.

Лактобактерії ростуть при зниженому напруженні кисню, тому вони зараховуються до мікроаерофільних мікробів.

Лактобактерії є частиною обов’язкової флори тонкої та товстої кишок, ротової порожнини та піхви.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Значення в кишечнику:

Зовнішні кишкові мікроби.
Захист від чужорідних мікробів, особливо за рахунок утворення коротколанцюгових жирних кислот (особливо молочної), перекису водню та різних бактеріоцинів.

Метаболічний спектр:

Лактобактерії - це чисті сахароліти, які виробляють коротколанцюгові жирні кислоти, особливо молочну кислоту, без газоутворення і, таким чином, викликають, зокрема, підкислення кишкового середовища.

Дріжджі

В даний час відомо близько 500 видів дріжджів. Найбільше клінічне значення мають представники роду Candida, який налічує майже 200 видів. Домінуючим видом у клінічних матеріалах є Candida albicans. Інші Candida spp., Saccharomyces spp., Trichosporon spp., Torulopsis spp., Rhodotorula spp., Cryptococcus spp. та Sporobolomyces spp. доведено.

Важливо: Докази зростання грибка в калі, особливо роду Candida, можуть бути адекватно оцінені лише у зв'язку зі станом хазяїна та обов’язковою флорою кишечника. Окремі спостереження за мікробами ігнорують їх опортуністичний характер. Таким чином, грибкова колонізація кишечника завжди є вторинним явищем і, відповідно, спочатку повинна оцінюватися симптоматично як ознака порушення резистентності до колонізації кишечника.

Дріжджі широко поширені в навколишньому середовищі.

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

Важливо: Кількість мікробів, виміряних у калі, не завжди відображає кількісні пропорції будь-якої колонізації грибків, яка могла відбутися в кишечнику. Отже, патогенетична оцінка виявлення грибків не повинна по-рабськи базуватися на кількості бактерій, а повинна базуватися на клінічних симптомах та стані кишкового бар’єру.

Значення в кишечнику:

Пасивні мікроби.
Доказ проходу також можливий у здорових людей завдяки широкому використанню дріжджів.
Поселення в кишечнику лише в тому випадку, якщо порушений кишковий бар’єр.

Метаболічний спектр:

Висока метаболічна активність.
Переважно вуглеводний оборот з виробництвом вуглекислого газу та етанолу.
Виробництво сивушних масел (амільного та ізоамілового спирту) в результаті азотного обміну

Прес-форми

У калі виявляються види родів Geotrichum, рідше - Mucor, Absidia, Rhizopus, Aspergillus та Penicillium.

Плісняві гриби широко поширені в навколишньому середовищі, особливо на рослинних матеріалах. Geotrichum spp. також є частиною нормальної мікрофлори багатьох молочних продуктів (наприклад, багатьох твердих і м'яких сирів).

Стандартний діапазон/діапазон допуску:

При переважно лакто-овочевій дієті в окремих випадках також підвищується кількість мікробів через збільшення споживання цвілі з їжею.

Значення в мікроекології кишечника:

Пасивні мікроби. Збільшення доказів здебільшого завдяки дієті.
Кишковий мікоз, спричинений цвіллю, як правило, лише у пацієнтів з важким імунітетом (СНІД, після хіміотерапії, важкий діабет).
Посилене виявлення Geotrichum spp. поширений при псоріазі та запальних захворюваннях кишечника. Однак поки що жодного етіологічного зв'язку не доведено.

Метаболічний спектр:

У кишечнику плісняви - також через переважно лише тимчасове виникнення - не мають жодних наслідків з точки зору їх метаболічної поведінки.