Дивовижне відкриття про ВІЛ
Вчені вважають, що ВІЛ або вірус імунодефіциту людини, який викликає СНІД, почав заражати людей у Центральноафриканському регіоні десь на початку 1900-х років, поширюючись на людей від шимпанзе. Існує період щонайменше 80 років з того моменту, як вірус ВІЛ почав передаватися людям до його відкриття, і тому значна частина динаміки мутацій, які зазнали цей вірус, спочатку залишається невідомою.
Однак нещодавно найдавніший майже повний геном вірусу ВІЛ був виявлений в Демократичній Республіці Конго в забутому зразку тканини, що датується 1966 роком, майже за два десятиліття до офіційного виявлення вірусу ВІЛ, повідомляє Agerpres. Інформацію опублікувала Live Science з посиланням на дослідження, опубліковане в останньому випуску “Proceedings of the National Academy of Sciences”.
Зразок тканини був відібраний та збережений у 1966 році, завдяки чому цей вірусний геном ВІЛ на 10 років старший за найстаріший відомий на сьогоднішній день геном ВІЛ (який бере участь у зразку крові, зібраному в 1976 році також з ДР Конго).
Чому важливо відстежувати генетичні мутації вірусу
Такі геномні послідовності, що походять з періоду до відкриття вірусу, що викликає СНІД (відкриття, що відбулося в 1983 році), сприяє виявленню генетичних мутацій, яким страждає цей вірус. У свою чергу, ці мутації допомагають дослідникам відстежувати, як ВІЛ поширюється і коли він почав заражати людей.
З цієї точки зору, нещодавно відкрита геномна послідовність є дуже актуальною, на думку Софі Грізліс, співавторки нового дослідження та докторської дослідниці з еволюційної та обчислювальної вірусології в Католицькому університеті в Левені (KU Leuven), Бельгія. Ця послідовність відповідає тому, як дослідники встановили період виникнення ВІЛ у людей, - сказала вона у заяві для Live Science.
"Це добре знати, бо це означає, що наші еволюційні моделі, які ми застосовуємо до вірусної послідовності, працюють добре. Ми не зустрічали великих сюрпризів ", - підкреслила вона.
Існує кілька штамів ВІЛ, але підгрупа, відповідальна за 95% випадків СНІДу у всьому світі Група ВІЛ-1 М. Більше 32 мільйони людей у всьому світі померли від СНІДу з початку цієї пандемії.
І як існує період щонайменше 80 років з того моменту, як вірус ВІЛ почав передаватися людям до моменту його виявлення, велика частина динаміки мутацій, які зазнали цей вірус, спочатку залишається невідомою.
Коли вірус став вірулентним?
Математичні моделі швидкості мутацій вірусу дають деякі підказки щодо того, коли почалася передача ВІЛ від людини до людини, яка потім перетворилася на пандемію. Але залишається одне питання: коли і чому підгрупа ВІЛ-1 М стала настільки плодовитою, що їй вдалося заразити стільки людей у всьому світі.?
Частина цієї проблеми полягає в тому, що математичні моделі, яким вдається розрахувати швидкість мутацій вірусу за останні роки, стають набагато менш точними, якщо враховувати їх протягом більш тривалих періодів часу, за словами Софі Грізліс. Це пов’язано з тим, що генетична інформація втрачається протягом тривалих періодів часу. Деякі вірусні штами зникають просто внаслідок природного відбору або просто внаслідок випадкових факторів, не залишаючи слідів їх існування в геномах вірусів, що циркулюють в даний час.
З цієї причини, відкриття давнього вірусного штаму - це як відкриття археоптериксу для палеонтологів. Це відсутність частини загадки про те, як ця сім’я вірусів еволюціонувала з часом.
Софі Гризел долучилася до поточного проекту, який проводив біолог Майкл Воробей з Університету Арізони, і разом з іншими дослідниками з Бельгії, США та ДР Конго проаналізувала 1645 зразків тканин біопсії з Центральноафриканського регіону під час 1958 - 1966 рр. Відібрані зразки консервували у формаліні, а потім покривали парафіном. Потім, використовуючи ПЛР-тести (подібні до тих, що використовуються для виявлення нового коронавірусу), дослідники шукали сліди геному ВІЛ. Зрештою вони виявили лише один такий слід: вірусна послідовність при біопсії лімфатичних вузлів у 38-річного чоловіка.
Чому нове відкриття важливе і що слід визначити дослідникам
Є також більш старі вірусні фрагменти ВІЛ - один з 1959 року та інший з 1960 року, також із ДР Конго. Але це є неповна і за замовчуванням вони не можуть надати інформацію про мутації, які зазнав цей вірус з часом. Ці два фрагменти також є частиною різних підтипів ВІЛ, на думку Гризелса, що це доводить цей вірус циркулює в людині ще до 1950-х років.
Наступною метою дослідників є з’ясування коли вірус ВІЛ-1 почав швидко поширюватися, епідемія. Можливо, відбулися деякі зміни в геномі вірусу ВІЛ-1, які зробили його більш ефективним, на думку Софі Гризелз. Але швидше за все, зміни в людському суспільстві вони зробили це можливим.
урбанізація швидко зростав на початку ХХ століття в Центральній Африці.
У період з 1910 по 1950 роки стали доступними кампанії з охорони здоров'я лікування для таких станів, як малярія, порушення сну та сифіліс. Але багато з цих кампаній не використовували ефективно стерилізовані медичні інструменти, що могло призвести до поширення ВІЛ.