Як Роб Найт випадково став дослідником мікробіомів - MyMicrobiome
Одним з найвидатніших представників досліджень мікробіомів є професор Роб Найт з Каліфорнійського університету, Сан-Дієго (>>> посилання на його лабораторію та поточні проекти). Своєю книгою "Бруд - це добре" (огляд книги) він завоював широку увагу за межами наукової спільноти. Найпізніше з успіхом цієї книги було зрозуміло, що широка ненаукова маса також цікавилася тим, що відбувається в нашому тілі, і як це впливає на наше повсякденне життя. Сам Найт довгий час не вірив в ефективність цього фокусу дослідження. Він надовго залишив дослідження мікробіомів цікавим побічним продуктом. Але часи змінилися.
Vita та професійна кар'єра
Роб Найт народився в Данідіні, Нова Зеландія, в 1976 році. Він старший із трьох синів, і батьки обоє імунологи - тому він знав фундаментальний інтерес до науки та досліджень ще в дитинстві. Дитинство та юність він провів у вражаючій природі Нової Зеландії і в ранньому віці почав цікавитись скам’янілістю та динозаврами, науково-фантастичними романами, а згодом і комп’ютерами. Поки що нічого незвичного для маленького хлопчика.
Чіткою відданістю цій галузі досліджень було зарахування його в Університеті Отаго на предмет біохімії в 1994 році. Він швидко зрозумів, наскільки він був захоплений лабораторними дослідженнями, і закінчив свої лекції та курси з подвоєною швидкістю як надокучливу обов'язкову програму. Лише через рік після зарахування він отримав стипендію на перебування в Принстонському університеті в Нью-Джерсі, США, де зміг отримати цінні знання в галузі генетики, а особливо в технології генного приводу (>>> Вікіпедія Ген Драйв).
Його найбільші досягнення
Закінчивши Отаго, він повернувся в Принстон у 1997 році з планом подальшої активізації своєї роботи в галузі еволюції та експериментальної біології. Однак у процесі його дослідницької кар'єри його фокус все більше переносився на програмування та переваги, які можна отримати від нього для досліджень еволюції.
Нарешті, він переніс фокус своїх досліджень на ДНК, зокрема на розшифровку кодування за допомогою комп’ютерних технологій. Тут він досяг феноменального розуміння, адже те, що раніше можна було описати лише як явище, Найт тепер міг пояснити математично.
Наступна професійна посада привела його до Університету Колорадо в Боулдері, США, де він обійняв пост-докторську посаду з досліджень РНК. Завдяки своїм навичкам обробки даних він зміг отримати важливе уявлення про декодування послідовностей та функцій РНК, таких як зв'язування білка. Наскільки складним є математичне досягнення, ілюструє той факт, що для обчислення був необхідний суперкомп’ютер. За допомогою цього він зміг ідентифікувати повторювані послідовності, так звані мотиви.
Завдяки Найту наука тепер знає, чому різні види використовують різні послідовності для кодування однієї і тієї ж амінокислоти. Розроблені ним програмні засоби дуже добре послужили подальшим дослідженням, оскільки те, що раніше обмежувалось емпіричним описом, тепер можна було записати кількісно. Дві найвідоміші програми з його пера - UniFrac (>>> Вікіпедія UniFrac) та QIIME (>>> Посилання QIIME).
Лицарський шлях до досліджень мікробіомів
Після докторантури Найт залишився в CU Boulder і досліджував секвенування рРНК разом з Норманом Пейсом. У цьому контексті Найт також розробив згаданий інструмент UniFrac. Його публікація за 2004 рік вже цитувалася понад 4000 разів.
Співпраця дослідників з Джеффрі Гордоном (>>> Посилання) призвела Найта до Школи медичних наук Вашингтонського університету в Сент-Луїсі, де він зміг поглибити свої знання з досліджень мікробіомів. Двоє вчених заглибилися у зв’язок між мікробіомом кишечника та загальним станом здоров’я - напрям, який Найт спочатку дотримувався лише з особистих інтересів. На той час ніхто за межами університету не цікавився мікробіомом. Найт і Гордон зробили цікаві висновки між бактеріями кишечника та ожирінням під час досліджень на мишах.
Найт, походячи з генетики, визнав зв’язок між ожирінням та впливом навколишнього середовища. Поки що ожиріння, як правило, пояснюється генетичними причинами. Подальші дослідження у 2009 році на парах близнюків людини, кожна з яких складається з одного ожиріння та одного тонкого близнюка, змогли чітко продемонструвати, що ожиріння у людей також пов'язане з певним сузір'ям бактерій у кишечнику (>>> Дослідження за посиланням). Найт зміг статистично обгрунтувати цю революційну знахідку за допомогою програми QIIME, і статтею, опублікованою в науковому журналі "Science" найпізніше в 2013 році, Найт та його команда раптово викликали суспільний інтерес, який давно заслужив цей предмет (>>> Посилання на статтю Наука ).
На основі аналізу лише мікробіому дослідники змогли визначити, із коефіцієнтом потрапляння 90%, чи страждає людина ожирінням чи ні. Обмежуючись генетикою, рівень досягнення становить лише 57%.
Подальші революційні висновки в дослідженнях мікробіомів
Зараз дослідження мікробіому людини дали низку інших захоплюючих і проникливих висновків: Найт зміг довести, що люди, які живуть разом у домогосподарстві, мають подібний мікробіом, навіть якщо, наприклад, місце їх проживання переселено. Отже, дієта була визначена ключовим компонентом, перш за все часткою м’яса в раціоні.
Швидко стало зрозуміло, що висновки Найта можуть мати стійкі наслідки для здоров'я широкої громадськості. Американський проект з кишечником (>>> Посилання) та Проект Мікробіом Землі (>>> Посилання) - це дві ініціативи, очолювані Робом Найтом, які спрямовані на поєднання освіти та знань і, безумовно, можуть бути описані як альтруїстичні проекти, що мають велику цінність. Благородна мета - не хто інший, як розшифровка мікробіома у всьому світі, щоб отримати від нього максимальну користь для людства.
Лицар як місток між наукою та населенням
Те, що проголошено в Американському проекті кишечника та Проекті мікробіомів Землі як місток між наукою та широкою громадськістю, Найт пропонує у своїх двох публікаціях "Бруд - це добре" (>>> Посилання) та "Слідуй своїм кишкам" (>>> Посилання) до досконалості.
Ці дві книги так яскраво ілюструють всі результати досліджень мікробіомів, що навіть неспеціалісти (які ще не зацікавилися) можуть розібратися в них у розважальній та зрозумілій формі.
На додаток до багатьох наукових заслуг, заслуга Роба Найта полягає перш за все в тому, щоб поінформувати маси людей до теми мікробіому і тим самим (сподіваємось) стійко покращити здоров'я населення на краще.