Metabolomics ICANalytics; Інститут кардіометаболізму та харчування ICAN

На шляху до персоналізованої медицини

Мета платформи метаболоміки полягає у розробці та забезпеченні інструментів для профілювання та/або кількісної оцінки при високій пропускній здатності всіх молекул, що належать до метаболома.

кардіометаболізму

Стратегія, розроблена на нашій платформі, базується на профілюванні великої кількості метаболітів з використанням мультидисциплінарних навичок, що поєднують біоінформатику, статистичні інструменти та біохімічні бази даних для інтерпретації результатів на високому мас-спектрометрі з роздільною здатністю та хроматографічними системами.

Послуги та обладнання

  • Дослідження метаболомів
  • Послуги: придбання та інтерпретація метаболомічних профілів
  • Ідентифікація та аналіз метаболітів (HRMS, MS/MS)
  • Аналіз та кількісна оцінка кількох сімейств метаболітів
  • Поради та впровадження метаболічних аналізів
  • Розробка та впровадження методів метаболоміки (власний метод)
  • Анотація та ідентифікація метаболітів

Доступні методи

Підхід цільові:

Абсолютна кількісна оцінка амінокислот, шляху триптофану, шляху метаболізму холіну (TMAO, холін…), коротколанцюгових жирних кислот (SCFA), жовчних кислот (у dvlpt)

Яметод профілювання:

Виявлення та відносна кількісна оцінка сполук, що відносяться до мікробіоти та належать до сімейства:

  • Спосіб 1: амінокислоти, органічні сполуки, феноли, метиламіни та деякі індоли
  • Спосіб 2: Ацилкарнітини, вільні жирні кислоти та жовчні кислоти

Нецільовий підхід:

Вивчення загального метаболома за допомогою декількох хроматографічних методів. Виявлення більше 200 метаболітів у біорідинах (плазма-сироватка)

Матриці біологічного дослідження.

Сироватка-плазма, ліквор, сеча, фекалії, сліпа кишка, PBMC та гліальні клітини. Інші матриці, що підпадають під умови пілотного дослідження (для отримання додаткової інформації зверніться до оперативного менеджера)

Мережі та співпраці

Подання проекту

Доступ до нашої платформи здійснюється через аналітичний запит (https://app.novabricks.com/ican/ican/)

Процедура після отримання "форми запиту" така:

  1. Подання форми запиту на платформу через “Аналітичний запит”
  2. Оцінка проекту та встановлення тарифної пропозиції
  3. Перевірка специфікацій та підписання кошторису/угоди
  4. Надходження зразків
  5. Виконання робіт згідно специфікацій (або кошторису)
  6. Презентація остаточного звіту про дослідження

Основні публікації

  • Ле Рой Т, Лекуер Е, Шассінг Б, Рімі М, Ломм М, Будебуз С, Ічоу Ф, Харо Барсело J, Huby T, Guerin M, Giral P, Maguin E, Kapel N, Gérard P, Clément K, Лесник П. Кишкова мікробіота регулює гомеостаз холестерину господаря, BMC Biol., 2019. PMID 31775890
  • Aron-Wisnewsky J, Prifti E, Belda E, Ічоу Ф, Kayser BD, Dao MC, Verger EO, ​​Hedjazi L, Bouillot JL, Chevallier JM, Pons N, Le Chatelier E, Levenez F, Ehrlich SD, Dore J, Zucker JD, Clément K. Основні дисбіози мікробіоти при важкому ожирінні: доля після баріатричної хірургії. Кишечник. 2019. PMID: 29899081
  • Del Mar Amador M, Colsch B, Lamari F, Jardel C, Ichou F, Rastetter A, Sedel F, Jourdan F, Frainay C, Wevers RA, Roze E, Depienne C, Junot C, Mochel F. Орієнтація проти нецільової оміки - Історія CAFSA. J Inherit Metab Dis. 2018. PMID: 29423831
  • Дао MC, Соколовська N, Бразель R, Affeldt S, Pelloux V, Prifti E, Chilloux J, Verger EO, ​​Kayser BD, Aron-Wisnewsky J, Ічоу Ф, Pujos-Guillot E, Hoyles L, Juste C, Doré J, Dumas ME, Rizkalla SW, Holmes BA, Zucker JD, Clément K; Консорціум MICRO-Obes. Передній Фізіол. 2019. Підхід до інтеграції даних Multi-Omics для вивчення змін чутливості до інсуліну, викликаних обмеженням калорій. PMID: 30804813
  • Гаралі І, Аданьєгух І.М., ІчоуF, Perlbarg V, Seyer A, Colsch B, Moszer I, Guillemot V, Durr A, Mochel F, Tenenhaus A. Стратегія мультимодальної інтеграції даних: застосування до ідентифікації біомаркерів при спіноцеребелярній атаксії. Брифінги з біоінформатики. 2017 рік
  • Kayser BD, Lhomme M, Dao MC, ІчоуF, Bouillot JL, Prifti E, Kontush A, Chevallier JM, Aron-Wisnewsky J, Dugail I, Clément K, Lipidomics сироватки виявляє ранні диференціальні ефекти шлункового шунтування порівняно із зв'язуванням на фосфоліпіди та сфінголіпіди, незалежно від різниці у втраті ваги. Міжнародний Дж. Обес. 2017 PMID: 28280270

Місцезнаходження та контакти

47-48 bd de l'Hôpital 75013 Париж ICAN - корпус E3M - 6 поверх

Оперативний менеджер: Фарід Ічу (Іран, ICAN)

Науковий керівник: Філіпп Лесник, (ДР, UMR ICAN 1166)

Біостатист: Доктор Махараджа Понная (Ірландія, ICAN)

Технік: Сора Лекок (Tech, ICAN)

Науковий комітет: Прем'єр-міністр Фанні Мохель (ICM), д-р Фуділ Ламарі (APHP), д-р Іво Гомпертс Бонека (Інститут Пастера), д-р Франсуа Фенай (CEA)