Побічні ефекти в деталях
Найбільш поширеною патологією у печінці є жирова печінка, яка є супутнім симптомом запального захворювання кишечника, що не потребує лікування. Причиною може бути неправильне харчування, втрата ваги або всмоктування токсичних речовин безпосередньо з кишечника.

Камені в жовчному міхурі
Камені в жовчному міхурі виявляються у приблизно 30% пацієнтів із ураженням клубової кишки після резекції ілеоцекальної зони та у хворих на коліт після видалення товстої кишки (). Причиною є нестача жовчної кислоти в кишечнику, що призводить до опадів в жовчі. Камені в жовчному міхурі зазвичай видаляють хірургічним шляхом, якщо вони викликають такі симптоми, як коліка.
Найбільш поширеним супутнім захворюванням печінки та жовчі у пацієнтів із запальним захворюванням кишечника є (). Це рубцеві зміни малих жовчних проток, розташованих у печінці, та/або більших жовчних проток, розташованих поза печінкою.
Рубці із звуженням жовчовивідних шляхів перешкоджають надходженню жовчі з печінки в кишечник - розвивається застій жовчі (). Застій жовчі призводить до накопичення жовтого пігменту крові () та жовчних, іноді токсичних продуктів виведення з печінкою. З іншого боку, в кишечник потрапляє занадто мало жовчі, яка використовується для жирів і жиророзчинних вітамінів.
На додаток до первинного біліарного цирозу, це одне з найважливіших захворювань, що призводить до хронічної жовчної конгестиї (хронічна холестатична хвороба печінки).