Сперматозоїди ожиріння - хроніки геноміки медицининауки

Бертран Йорданія 1, 2 *

1 UMR 7268 ADÉS, Екс-Марсель, Університет/EFS/CNRS, Середземноморський етичний простір, лікарня для дорослих Ла-Тимоне, 264, вулиця Сен-П'єр, 13385 Марсель Седекс 05, Франція
2 CoReBio PACA, коробка 901, Науковий парк Luminy, 13288 Марсель Седекс 09, Франція

Демонстрація (дещо) специфічного диференціального вмісту РНК та метилювання ДНК у спермі від людей із ожирінням відкриває можливість епігенетичної передачі потомству.

геноміки

(→) Див. Тематичний випуск DOHaD, РС n ° 1, січень 2016 р

(→) Див. Також тематичний випуск DOHaD, РС n ° 1, січень 2016 р

Худий і товстий: досить тонкі відмінності

Автори проаналізували сперму 13 людей із нормальною надмірною вагою (середній ІМТ 22,9) 1 та 10 із ожирінням (середній ІМТ 31,8) з точки зору позиціонування гістонів (шляхом перетравлення нуклеаз Мікрокок 2), невеликий вміст РНК, що не кодує (малі некодуючі РНК, sncRNAs) та метилювання (шляхом секвенування після обробки бісульфітом). Жодної різниці між цими двома групами не спостерігалося щодо розташування гістонів. На рівні sncRNA найбільш представленими видами є переносні фрагменти РНК, а також РНК, що взаємодіють з білками Piwi (piRNAs), які беруть участь у регуляції експресії генів [8]. Значні відмінності в експресії спостерігаються приблизно для 40 піРНК, деякі з яких можуть регулювати гени, що беруть участь в апетиті. Виявлені відмінності, проте, незначні, з частковим або іноді повним перекриттям значень, що спостерігаються у двох групах. (Фігура 1).

Диференціальна експресія піРНК у "худих" та "жирових". На осі y рівень експресії нормалізується до загальної кількості піРНК у зразку; синій: тонкі предмети, червоний: товсті предмети. Це, мабуть, найгостріші різниці, але ми можемо бачити, що вони значною мірою перекриваються. Чорні точки відповідають значенням, які автори вважають відхиленнями (витяг з рисунка 2 Донкіна та ін. [6]).

Дані метилювання показують, що багато генів, понад 9000, диференційовано метильовані, іноді значні відмінності між спермою з обох груп. Аналіз природи цих генів (анотація Онтологія генів) показує помірне збагачення для тих, хто бере участь у розвитку та функціонуванні центральної нервової системи (Малюнок 2). Автори встановлюють зв'язок з роботою, що вказує на підвищений ризик аутизму у дітей ожирілих батьків [9] - з огляду на скромність спостережуваного збагачення (Малюнок 2), проте можна залишатися досить скептичним. Нарешті, аналіз варіантів ДНК, які, як відомо, беруть участь у ожирінні, виключає, що вони відповідають за спостережувані відмінності (іншими словами, це генетичне явище, а не епігенетичне).

Гени, анотовані у функціональному відношенні (Онтологія генів) в базах даних. Рожевим: диференційовано метильовані гени; синім: набір анотованих генів. Видно, що гени, що належать до представлених категорій, дещо частіші серед диференційовано метильованих генів (витяг з рисунка 3 Донкіна та ін. [6]).

Отже, загалом існує багато епігенетичних відмінностей між спермою «худих» та сперми «жирних» - але ці відмінності досить тонкі та важкі для інтерпретації з огляду на їх складність. Потім автори винахідливо використають існуючу медичну ситуацію, щоб спробувати підтвердити свої результати.

Оперований ожирінням: "експериментальна система"

"Сугестивне" дослідження, але все ж попереднє та неповне

(→) Див. Геномну хроніку Б. Джордана, РС n ° 3, березень 2013 р., сторінка 325

Посилання, що цікавлять

Автор заявляє, що не має ніякого інтересу стосовно даних, опублікованих у цій статті.

Пам'ятайте, що індекс маси тіла (ІМТ, ІМТ Індекс маси тіла англійською мовою) дорівнює масі випробуваного (у кг), поділеній на квадрат його зросту (у метрах). Норма для дорослої людини - від 20 до 25.

Нуклеаза Мікрокок походить від Золотистий стафілокок. Це відносно неспецифічна ендо-екзонуклеаза.

Обмежувальна та всмоктуюча техніка, яка дозволяє зменшити як кількість вживаної їжі (розмір шлунка зменшується до маленької кишені), так і засвоєння цією їжею організмом завдяки короткому замиканню `` частини шлунка і кишечника. Їжа надходить безпосередньо в середню частину тонкого кишечника і тому засвоюється в менших кількостях.

Список літератури

  1. Походження здоров'я та хвороб у розвитку (DOHaD). Середовище та епігенетика. Med Sci (Париж) 2016; 32: 3–130. [Google Scholar]
  2. Lumey LH. Зниження ваги народжених немовлят після внутрішньоутробного впливу голландського голодомору 1944–1945 років. Paediatr Perinat Epidemiol 1992; 6: 240–253. [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  3. Чесі А, Грант СФ. Генетика дитячого ожиріння. Тенденції Ендокринол Метаб 2015; 26: 711–721. [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  4. Lake JK, Power C, Cole TJ. Індекс маси тіла від дитини до дорослого в британській когорті народжень 1958 року: асоціації з ожирінням батьків. Arch Dis Child 1997; 77: 376–381. [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  5. Пембрі М, Саффері Р, Бигрен Л.О. Мережа в епігенетичній епідеміології. Реакції трансгенерацій людини на досвід раннього життя: потенційний вплив на розвиток, здоров'я та біомедичні дослідження. J Med Genet 2014; 51: 563–572. [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  6. Донкін І, Верстейхе С., Інгерслев Л.Р. та ін. Ожиріння та баріатрична хірургія обумовлюють епігенетичні зміни сперматозоїдів у людей. Cell Metab 2016; 23: 1–10. [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  7. Кох Л. Епігеноміка: сперма як пропагатор ожиріння? Nat Rev Genet 2016; 17: 6. [PubMed] [Google Scholar]
  8. Esposito T, Magliocca S, Formicola D, Gianfrancesco F. piR_015520 належить до асоційованих з Piwi РНК, що регулює експресію гена рецептора мелатоніну 1А людини. PLoS One 2011; 6: e 22727. [CrossRef] [Google Scholar]
  9. Surén P, Gunnes N, Roth C, et al. Ожиріння батьків та ризик розладу спектру аутизму. Педіатрія 2014; 133: e1128 - e1138. [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  10. Джордан Б. Епігенетика та стійкість. Med Sci (Париж) 2013; 29: 325–328. [CrossRef] [EDP Sciences] [PubMed] [Google Scholar]

Список малюнків

Диференціальна експресія піРНК у "худих" та "жирових". На осі y рівень експресії нормалізується до загальної кількості піРНК у зразку; синій: тонкі предмети, червоний: товсті предмети. Це, мабуть, найгостріші різниці, але ми можемо бачити, що вони значною мірою перекриваються. Чорні точки відповідають значенням, які автори вважають відхиленнями (витяг з рисунка 2 Донкіна та ін. [6]).

Гени, анотовані у функціональному відношенні (Онтологія генів) в базах даних. Рожевим: диференційовано метильовані гени; синім: набір анотованих генів. Видно, що гени, що належать до представлених категорій, дещо частіші серед диференційовано метильованих генів (витяг з рисунка 3 Донкіна та ін. [6]).

Поточні показники використання показують сукупний підрахунок переглядів статей (повнотекстові перегляди статей, включаючи перегляди HTML, завантаження PDF та ePub, відповідно до наявних даних) та подання тез на платформі Vision4Press.

Дані відповідають використанню на платформі після 2015 року. Поточні показники використання доступні через 48–96 годин після публікації в Інтернеті та оновлюються щодня по днях тижня.

Початкове завантаження метрик може зайняти деякий час.