Коронавірус ми пояснюємо вам, чому ми можемо; хворіти попри; російський тест; додаткові (навіть якщо
Техніка молекулярної біології (ПЛР) є надійною та освоєною. Однак заражена людина може отримати негативні результати, якщо мазок з носоглотки не є якісним або якщо вірус вже мігрував у глибокі дихальні шляхи.
Після млявого початку Франція нарешті вирішила збільшити темп виявлення коронавірусу. Хоча щоденна кількість біологічних тестів (ПЛР) все ще складала близько 5000, десять днів тому міністр охорони здоров’я Олів’є Веран оголосив про наступне збільшення, у вихідні дні - від 25000 до 30000, а у червні - 100000.
Однак чи варто довіряти результатам із закритими очима? Відповідь полягає більше в характеристиках захворювання, ніж у самій техніці. Пояснення.
Важливість жесту під час зразка
"Якість зразка становить 90% від якості тесту", - резюмує Бруно Поццетто, керівник відділу вірусології в ЦУ Сент-Етьєн (Луара), де щодня проводяться 300 скринінгів Covid-19. "Вам потрібно просунути тампон у задню частину горла, за лінію очей. Існує ризик трохи розплакати пацієнта, трохи поранити його, але це майже фактор успіху". Це відео з журналу New England Journal of Medicine показує всю ретельність, необхідну для взяття цих зразків, які дуже неприємні для пацієнта.
"Це технічний жест, додає Ніколас Левек, керівник відділу вірусології CHU де Пуатьє. Якщо це зроблено погано, це може багато в чому пояснити, що помилково приписують" помилковим негативам ". Технічність цієї операції пояснює застереження показані певними спеціалістами щодо розробки "тест-драйву", під час якого випробувані залишаються у своєму автомобілі. Але Ніколас Левек не погоджується. "У відділі це наші колеги з лабораторії Bio 86, які проводять ці маршрути. зразки. Ці приватні медичні біологи звикли до цих жестів, і я їм цілком довіряю ".
Занадто низьке вірусне навантаження? Проста гіпотеза
Потім ці зразки є предметом біологічних тестів, які називаються "ПЛР" (полімеразна ланцюгова реакція), а точніше "rt-PCR" ("rt" для "зворотної транскрипції", оскільки фермент спочатку перетворює РНК вірусу, якщо вона у зразку цей геном вірусу SARS-CoV-2 ампліфікується протягом приблизно сорока циклів, щоб отримати легко виявлену кількість. Чим більше з'являється сигнал про зараження. чим раніше в ланцюговій реакції ампліфікації, чим вище початкове вірусне навантаження, і чим вище вірусне навантаження, тим заразніший пацієнт.
Якщо вірусне навантаження занадто низьке у пацієнта, наприклад, на самому початку зараження, чи можливо тест негативний? Питання на сьогодні ще не вирішено.
"Тести молекулярної біології ПЛР дуже чутливі, і вірусні навантаження дійсно повинні бути дуже низькими", - говорить Ніколас Левек. Однак те, що ми бачимо для інших респіраторних інфекцій, таких як грип, полягає в тому, що кількість вірусу важлива з самого початку, тому не є моєю інтуїцією, хоча я не виключаю цієї гіпотези ".
Негативні результати, коли вірусне навантаження занадто низьке? Тому це ще слід довести. І навіть у цій гіпотезі тести ПЛР зберегли б усі свої епідеміологічні інтереси. Насправді пацієнт із крихітним вірусним навантаженням рідше передає інфекцію. Таким чином, тест все одно дозволить ідентифікувати заразних носіїв і, отже, поставити їх в ізоляцію.
Так само, додає професор вірусології, "між різними наборами тестів можуть бути відмінності в чутливості, але я не думаю, що набір є настільки поганим, щоб пропустити позитивні зразки".
На запущеній стадії необхідно провести пошук бронхіол
По правді кажучи, головна складність тут не в тому. Якщо якість зразка може вплинути на результат, також слід враховувати час скринінгу. Дійсно, вірусна локалізація, схоже, еволюціонує під час захворювання.
При добре запущеній формі захворювання, тобто через 7-й або 8-й день, інфекція потрапляє в нижні дихальні шляхи.
Бруно Поццетто, завідувач відділом вірусології в ЦУТ Сент-Етьєндо franceinfo
На даний момент носоглотка вже не є ідеальною областю для взяття проби. Потім необхідно приступити до бронхоальвеолярних промивань, що проводяться під ендоскопією. Операція полягає у проведенні потоку декількох десятків мілілітрів фізіологічної сироватки на дно бронхіол. Легені промивають, а потім цю сироватку всмоктують назад, перш ніж поміщати в стерильну банку. "Це найблагородніший і найчистіший зразок для тестування на легеневу інфекцію, пояснює Бруно Поццетто, оскільки ми впевнені, що його не забруднить бактеріальна флора, яка присутня в носоглотці, трахеях і на початку бронхів".
"Міграція вірусів" пояснює, що "бронко-альвеолярні промивання [в бронхіолах] можуть дати позитивні результати, тоді як зразки мазків дають негативні результати, додає професор. Це вже явище. Відоме деяким грипом". Вінсент Тібо, завідувач відділу вірусологічної лабораторії Університетської лікарні Ренна, також обговорює цей аспект щодо France Bleu Armorique. "Ми беремо зразки з носа, але ми знаємо, що вірус не виявляється в носі на всіх стадіях захворювання".
Це не означає, що тест не є хорошим, але що ми шукаємо вірус там, де його не виявляють на всіх стадіях захворювання.
Вінсент Тібо, з вірусологічної лабораторії університетської лікарні Реннау France Bleu Armorique
Отже, негативний тест може бути пов'язаний із запізнілим скринінгом. Вірусолог з університетської лікарні Лілля Енн Гоффар навіть дає деякі оцінки в щоденнику La Croix. "Коли ми беремо з носа, ми виявляємо 40% позитивних випадків" у підозрюваних пацієнтів, але ця цифра сягає, за її словами, 80% у тих самих людей, "коли ми беремо глибше". Однак ці пацієнти вже перебувають у стані, що вимагає госпіталізації або навіть реанімації. Потім ПЛР, проведена з бронхоальвеолярного зразка, формалізує інфекцію, яка вже не викликала сумнівів.
"Зразка носоглотки достатньо в 99% випадків"
"Виявлення вірусних РНК із бронхоальвеолярного промивання необхідне для діагностики та моніторингу вірусів у важких випадках", підкреслює китайське дослідження, яке все ще чекає вичитки. Однак ендоскопія є складним методом для узагальнення і призначена для найбільш важкохворих пацієнтів. Автори дослідження також оцінюють якість інших менш нав'язливих зразків та наголошують на кращій якості зразків мокротиння (від 74,5% до 89% позитивних результатів) порівняно із зразками носоглотки (від 53,5% до 73%) для ПЛР-тестів.
Однак зібрати цю мокроту не так просто. "Якщо ми не хочемо виділення слинної мокроти, необхідно викликати фізіотерапевта або реаніматолога, коли пацієнт інтубірований", - підкреслює Ніколас Левек, який підрахував, що "зразок носоглотки достатній у 99% випадків для банальних форм захворювання, тим більше, що з нею легше впоратися в лабораторії ". З іншого боку, і "якщо тест негативний, незважаючи на сильну підозру на зараження, можливо, доведеться піти далі". Крім бронхоальвеолярного промивання, рентген та сканування легенів можуть супроводжувати діагностику.
Що ще дивніше, нарешті, тест може бути негативним навіть у пацієнта, який перебуває в реанімації з респіраторним дистрес-синдромом. Здається, хвороба проходить двома шляхами: насичення легенів вірусами або, навпаки, їх запалення через занадто сильну реакцію імунної системи. В останньому випадку, і це весь парадокс, від вірусу більше не буде сліду, підкреслює Ніколас Левек. "Техніка ПЛР дуже добре виявляє, поки є що виявити".