Новий метод тестування дозволяє виявити коронавірус у сильно розбавлених зразках полоскання - ліки Біермана
Фармацевти Університету Мартіна Лютера Галле-Віттенберг (MLU) зуміли виявити найменші кількості коронавірусу SARS-CoV-2 за допомогою мас-спектрометрії.
Для розслідування вони використовували розчини, якими люди, які страждають на COVID-19, полоскали горло. У майбутньому новий метод може слугувати доповненням до тестів, які використовувались раніше. Зараз він вдосконалюється, щоб стати стандартним діагностичним інструментом. Перші результати були опубліковані в “Journal of Proteome Research”.
Щоб точно визначити, чи хтось гостро хворіє на COVID-19, в даний час існує, зокрема, один надійний метод тестування: ланцюгова реакція полімерази, або коротше ПЛР. Він виявляє генетичний склад вірусу і тому є дуже специфічним. Інші тести, навпаки, зазвичай виявляють антитіла проти хвороби - але організм виробляє їх лише в процесі інфекції, так що вони служать лише для виявлення минулого або запущеного захворювання. Тести на антитіла також часто є неспецифічними і в деяких випадках не можуть диференціювати різні коронавіруси, які можуть виникати у людей. Тому випробувальні лабораторії у всьому світі досягають межі своїх можливостей.
Професор доктор Андреа Сінц, експерт з мас-спектрометрії в Інституті фармації при MLU, виникла ідея розробити новий тест на основі мас-спектрометрії для доповнення ПЛР. Мас-спектрометрія дозволяє точно ідентифікувати молекули на основі їх маси та заряду. Сінц та її колеги розробили метод пошуку компонентів вірусів SARS-CoV-2. "Ми безпосередньо вимірюємо пептиди, що походять від вірусу, а не генетичний матеріал", - пояснює Сінц.
Для експериментів Університетський медичний центр Галле надав розчини для булькання від трьох пацієнтів із COVID-19. Робоча група Sinz ‘розробила метод ідентифікації компонентів вірусу у сильно розведених зразках. "Хоча ми отримали лише невеликий розчин для полоскання горла, нам вдалося знайти компоненти білків вірусу", - каже доктор. Крістіан Ілінг, який проводив тести.
"Це було досить дивно, я не сподівався, що це справді спрацює", - додає Сінц. Тест є високоспецифічним для вірусу, оскільки відповідні білки містяться лише в ГРВІ-CoV-2. Крім того, його можна використовувати для хорошого тестування на початковій фазі захворювання, коли в роті та горлі є багато вірусів.
Наразі тест можна провести приблизно за 15 хвилин, говорить Сінц. Зараз робоча група намагається ще більше скоротити аналіз. В даний час вона використовує для цього штучно виготовлені вірусні компоненти. Sinz також шукає подальшої співпраці, в тому числі з промисловістю. "З компанією з Гессена ми хочемо застосувати інший мас-спектрометричний метод, при якому вимірювання можна проводити протягом декількох секунд", - говорить фармацевт.
Тоді цей метод можна порівняти з так званим "біотипуванням", яке вже встановлено в клініках для діагностики бактеріальних або грибкових інфекцій. Однак ще слід показати, чи підходить цей підхід для виявлення ГРВІ-CoV-2. Тоді підготовка зразків не буде трудомісткою, і вимірювання також може проводити неспеціалізований персонал.
Новий метод діагностики за допомогою мас-спектрометрів ще не буде доступний відразу. Сінц сподівається, що вона буде готова до дії через кілька місяців: "У мене є тісний обмін з колегами з усього світу, серед яких пандемія набагато гірша, ніж у нас". Вона також є членом-засновником "Коаліції з масової спектрометрії COVID-19", дослідницька група, яка прагне краще зрозуміти хворобу за допомогою мас-спектрометрії.