Термінатор (генетика) - біологія

Коли Термінатор або Термінатор транскрипції є частиною генетичної послідовності на ДНК, що позначає кінець гена або оперона. Це призводить до припинення транскрипції.

У прокаріотів відомі два класи термінаторів транскрипції:

  • Власні термінатори транскрипції
  • Rho-залежні термінатори транскрипції

Термінатор зазвичай складається з короткої послідовності (4-10) пар основ GC і знаходиться всередині РНК майже відразу після стоп-кодону, який описує кінець ORF. Білки, що блокують припинення транскрипції, називаються антитермінаторами.

Незалежне від Rho припинення

При цьому типі закінчення у транскрипті РНК розвивається вторинна структура у формі шпильки. Причина криється в особливій послідовності основ.

Оптимальна структура для власного термінатора [1] має такий вигляд:

генетика

  • Деформована ГК багата область 1 (6-8 пар основ)
  • Петлеутворююча область (3-5 пар основ)
  • Деформована ГК багата область 2 (6-8 пар основ)
  • Поліурацилова область (3-8 пар основ)

Два багаті на ГК регіони об'єднуються, утворюючи так званий стовбур. Область між ними утворює так звану петлю або петля. Ця структура шпильки призводить до тривалої паузи в подовженні. Це корелює прямо пропорційно стабільності структури шпильки. Наступні 3-8 залишків урацилу дестабілізують комплекс подовження [2]. Популярна теорія полягає в тому, що структура шпильки укорочує гібрид РНК/ДНК, а нестійке спарювання АС ще більше дестабілізує комплекс. Наслідком цього є звільнення стенограми [3] .

Важливість структури шпильки для закінчення

Структура шпильки сприяє припиненню двояко [4] [5]

  • Структура шпильки РНК призводить до аллостеричного пригнічення додавання нуклеотидів в активному центрі. Це зупинить RNAP.
  • Структура шпильки забезпечує відокремлення гібриду РНК - ДНК на кінці 5’–.

Rho-залежне припинення

На відміну від власних термінаторів, rho-залежне закінчення не містить ніяких дестабілізуючих елементів послідовності ДНК. Тут термінація каталізується фактором термінації Rho. Комплекс елонгації дестабілізується геліказною активністю фактора Rho [6]. Ро визнає тут багаті на С розділи стенограми як гексамер. Він зв'язується з ділянкою приблизно 100 п.н. вище за течією комплексу подовження на щойно синтезованій транскрипті РНК. Rho рухається до 3 'кінця РНК завдяки своїй активності АТФази. Ця геліказна активність фактора термінації призводить до відокремлення гібриду РНК/ДНК. Наслідком є ​​дисоціація комплексу елонгації та вивільнення транскрипту РНК [7] .

Відзнака

Термінаторні послідовності на ДНК слід відрізняти від термінаторних кодонів на мРНК, що призводить до припинення трансляції.