UMR1348 PEGASE - Генетична теза про ефективність кормів у несучок

Генетика ефективності кормів у несучок

Харчова ефективність та жирові відкладення

Основна модель дослідження складається з двох ліній курей-несучок, відібраних на 40 років за показниками залишкової ефективності кормів, риси економічного значення у тваринництві. Тому цим тваринам дуже протиставляється ефективність харчування, а також ожиріння тіла.
Крім того, в рамках програми ANR Chickstress ці лінії зазнавали теплового стресу або харчового стресу (неоптимальна дієта). Оскільки ці тварини виробляються у всьому світі і мають тривалу виробничу кар’єру, вони особливо сприйнятливі до будь-якого з цих стресів.

генетична

Завдання дипломної роботи

  • Вивчення адаптації курей-несучок до стресових умов за допомогою збору різних фенотипів та транскриптомів за допомогою багатотканної РНК-послідовності.
  • Вивчення генетичних маркерів харчової ефективності та ожиріння організму, поєднуючи, з одного боку, ідентифікацію слідів виділень, аналіз транскриптомів (маркери типу РНК) за допомогою РНК-послідовностей у ключових тканинах для цих двох знаків (крові, печінки, жирової тканини) тканини та гіпоталамус), а також аналіз цілих геномів (маркери типу SNP, INDEL та ін.) за допомогою ДНК-послідовностей на наших цікавих лініях.
  • Вивчення зв'язку генотип - тканина - експресія, завдяки накопиченню даних про експресію тканин за допомогою РНК-послідовності, з метою кращого розуміння регуляції експресії генів на рівні транскриптів, у роботі роботи консорціуму GTEX.

Ідентифікація причинних генів, уражених поліморфізмом

На причинно-наслідкові гени, які сьогодні найбільш ідентифіковані, впливає поліморфізм, що змінює структуру кодованого білка. Під час цієї дипломної роботи експериментальна установка дасть можливість піти далі шляхом виявлення причинно-наслідкових генів, які регулюють експресію інших генів і не кодують білок (довга некодирующая РНК), а також гени, кодуючі чи ні, під впливом поліморфізму, що змінює кількість створених стенограм.

Ефекти варіанта залежать від області гена, в якій він з'являється (транскрибується проти регуляторного) та типу гена, що зазнає впливу (кодування проти некодування).

В: варіант, що впливає на транскрибовану та трансліровану частину кодуючого гена, може змінити структуру кодованого білка.B: варіант, що впливає на транскрибовану частину некодуючого гена, може впливати на функцію цього гена; ці гени вважаються регуляторами.C: варіант, що впливає на регуляторну область кодуючого гена, може впливати на кількість продукованої мРНК, а отже, на кількість перекладеного білка.D: Варіант, що впливає на регуляторну область некодуючого гена, може впливати на кількість утвореної некодуючої РНК, впливаючи на експресію генів, які він регулює.

Фредерік Єль працював над цією темою дипломної роботи з 1 листопада 2017 року протягом 3 років. Його керівництвом є Сандрін Лагарріг у команді з генетики та геноміки, а співпрацевником - Тетяна Зерджал з команди PSGen (UMR Gabi).

Зв'язок

Фредерік Єль, frederic.jehl[в]inra.fr

Надіслати цей вміст другові Роздрукувати цей вміст

Редакція: Пегаза
Дата створення: 13 лютого 2018 року
Оновлено: 05 січня 2021 року