Візуалізація подібності людської та хімічної ДНК; EWSTПерекласти

Каліфорнійський університет - Ріверсайд
Ріверсайд, Каліфорнія 92521

подібності

Недавня публікація повного геному шимпанзе, позначена випуском журналу Nature, говорить нам, що у людей та шимпанзе 96% однакового генетичного матеріалу. Цю кількість важко зрозуміти, а це означає, що ми ділимо 96% нашої ДНК із найближчими живими кузенами.?

Пряме дослідження ДНК не є корисним. Наприклад, розглянемо перші 100 пар основ мітохондріального поля ДНК:

gtttatgtagcttaccccctcaaagcaatacactgaaaatgtttcgacggggtttacatcaccccataaacaaacaggtttggtcctagcctttctattag…

і перші 100 основних пар мітохондріальної ДНК людини:

gatcacaggtctatcaccctattaaccactcacgggagctctccatgcatttggtattttcgtctggggggtgtgcacgcgatagcattgcgaggg

Подібність дуже важко оцінити, а повний геном як для людини, так і для шимпанзе насправді становить близько 3 мільярдів пар основ.!

Ми створили простий інструмент, щоб дозволити людям візуалізувати та зрозуміти подібність/несхожість послідовностей ДНК. Хоча цей документ наразі не публікується і все ще триває, ми опублікували відео про ДНК людини та шимпанзе, яке збігається з публікацією повного геному шимпанзе.

Відео триває близько 2 хвилин і є повністю автономним. Нижче наведена версія Youtube, можливо, ви віддасте перевагу бачити нижче самостійні версії з більш високою роздільною здатністю.

  • Google Video вже тут .
  • Відтворити версію Quicktime у браузері: Увага, найкраща якість, але великий файл. Перш ніж відтворити відео, може знадобитися кілька хвилин.
  • Відтворити версію AVI у браузері.
  • Відтворіть версію MP4 у браузері.
  • Клацніть правою кнопкою миші, щоб завантажити версію Quicktime: Увага, великий файл (безкоштовний програвач).
  • Клацніть правою кнопкою миші, щоб завантажити версію AVI
  • Клацніть правою кнопкою миші, щоб завантажити версію MP4

Коротка біографія учасників:

  • Доктор Імонн Кеог - доцент кафедри інформатики в UCR. Сфера наукових інтересів - видобуток даних та візуалізація.
  • Доктор Стефано Лонарді - доцент кафедри інформатики в UCR. Сфера наукових інтересів - обчислювальна молекулярна біологія.
  • Доктор Віктор Б. Зордан - доцент кафедри інформатики в УЦР. Сфера наукових інтересів - комп’ютерна графіка.
  • Доктор Санг-Хі Лі - асистент кафедри антропології в УЦР. Сфера наукових інтересів - еволюція людини та систематика.
  • Манель Яра є студентом Автономного університету Барселони і був студентом UCR в 2005 році.

Якщо ви хочете згадати цей документ, будь ласка, використовуйте:

Е. Кео, С. Лонарді, В. Б. Зордан, Ш. Лі та М. Джара (2005). Візуалізація подібності людської та хімічної ДНК. (Мультимедійне відео). http://www.cs.ucr.edu/

Дякуємо Коліну Креншоу, Біллу Юань-чі Чіу та Анвару Аді за допомогу та пропозиції. Музика у відео - Шопен - Балада No 4 фа-мінор, Op.52, Andante con moto у виконанні доктора Санг-Хі Лі .