Біохімічне стажування II - PDF Безкоштовно завантажити
1 Біохімічне стажування II 3-тижневе стажування за основним курсом біохімії WS 2010/11 Інститут біохімії Biozentrum Max-von-Laue-Straße Франкфурт-на-Майні Тел .:
2 Зміст 1 Загальний графік Довідка щодо створення лабораторного протоколу Біоінформатика Інструкції з приготування буферів Пептидний транспортер TAP Мембранний препарат із клітин комах Sf9 (експеримент 1 A) Позначення пептидів йодоацетамідомфлюоресцеїном (експеримент 1B) Визначення спорідненості (значення KD) пептиду до TAP (Експеримент 1C) Дослідження нуклеотидного зв’язку TAP (Експеримент 1D) Аналіз транспорту пептидів (Експеримент 1E) Функціональна характеристика домену зв'язування нуклеотидів MDL Надмірна експресія MDL1-NBD в E. coli (Експеримент 2A) Очищення MDL1-NBD або MDL1 (E599Q) (Експеримент 2B) Тест активності АТФази (Експеримент 2C) Дімеризація мутанта EQ (Експеримент 2D) Загасання флуоресценції для визначення константи швидкості димеризації MDL1 (E599Q) -NBD (Експеримент 2E)
4 Загальне 3 Іспит на все стажування BC-II (PEI, GSH, BC) та лекцію з біоаналітики відбудеться у п’ятницю о 9:30 у будівлі Biozentrum N100, кімната 0,15. Результати будуть розміщені у фойє Інституту біохімії та опубліковані на нашому веб-сайті не пізніше. Для складання іспиту потрібно 50% балів. Керівник стажування професор Роберт Тампе П.Д. Лікар. Руперт Абеле Керівник Крістоф Бальдауф Др. Катаріна Чех Ірина Бангерт Фолькер Гаттердам Герда Гюндіш Сабіне Хюльпке Крістін Кіоше Олександр Кліфен Ноемі Лабораторія Тім Лін Сабіне Шмідт Герхард Шпац-Кюмбель Франц Тумулка Агнес Виціск
9 Довідка щодо створення протоколу стажування 8 Приклад: BEISMANN-DRIEMEYER, S. та TAMPE, R. (2004): Функція механізму транспорту антигенів TAP у клітинній імунній системі Енджу. Chemie 116, Бібліографія відсортована за алфавітом відповідно до першого автора! (Ми рекомендуємо програму Citavi (безкоштовно на домашній сторінці університету) для створення бібліографії. F. Додаток. У деяких випадках слідує додаток, який зазвичай складається з довших таблиць із даними вимірювань або більших цифр. Висновок Під час написання протоколу намагайтеся бути повним і чітким Коли ви закінчите читати текст для правдоподібності, структури та формулювання, а також для орфографічних помилок, прочитайте текст ще раз і/або попросіть когось про допомогу! Коментар Якщо це має сенс, заохочуються відхилення від цих вказівок, творчість не карається!
17 Біоінформатика 16 Ця сторінка надає багато інформації про ACE2, включаючи перелік послідовностей білків (в однобуквенному коді) та послідовності ДНК. Що ви можете сказати про функцію ACE2? З якого організму його клонували? Де була опублікована наукова робота? Зверніть увагу, що є посилання на Medline, яке дозволяє побачити реферат статті.
18 Біоінформатика 17 Функції послідовності включають такі регіони, як "cds" (кодуюча послідовність ДНК). Це говорить вам про область кодування ДНК - область, яка була перекладена для отримання послідовності білка. У якому положенні починається і закінчується послідовність кодування? Деякі записи послідовностей містили більше одного гена. Подивіться номер доступу X (Ви можете повторити пошук або скористатися кнопкою повернення браузера, щоб знайти його) Відобразіть цю послідовність у графічному форматі (за посиланням у верхній частині сторінки). Ви повинні побачити таку сторінку, як наведена нижче. Перегляньте посилання на цій сторінці, щоб побачити іншу інформацію про цей регіон. Меню "Обмеження" та "Попередній перегляд/індекс" (і команди "Поля пошуку") набагато корисніші при пошуку в базах даних нуклеотидів та білків, ніж у літературних базах даних. Ви можете знайти список усіх полів пошуку та їх кодів, що використовуються в базах даних послідовностей, у довідковому посібнику Entrez тут. Приклад: Використовуйте обмеження, щоб знайти всі послідовності людини (крім EST та STS), додані до бази даних з 1998 року:
20 Біоінформатика Скільки послідовностей нуклеотидів (за винятком EST) із хлоропластів тютюну є в базах даних? 5. Очевидно, "король" перейшов від рок-н-ролу до аналізу послідовностей ДНК довгий час після його загибелі. Знайдіть номери приєднання послідовностей ДНК, про які повідомив Елвіс Аарон Преслі. Необхідне читання: Довідковий посібник Ентреза Ентреза Перейти до наступного розділ.