Кишковий BIOCODEX BMI PRO

Мікробіота кишечника складається з найрізноманітніших анаеробних бактерій.

Збільште його композицію.

Приблизно століття відомо, що травна система колонізована бактеріями, необхідними для нормального функціонування травлення, обміну речовин та імунітету. Ця бактеріальна екосистема, яка називається мікробіотою кишечника, специфічна для кожної особини як кількісно, так і якісно. У середньому мікробіота кишечника людини складається із 100 000 мільярдів бактерій, що перевищує загальну кількість клітин в організмі. Вони походять із групи сотень різних видів, в основному анаеробних або надзвичайно чутливих до кисню. Ця панель складається із загальної бази від 15 до 20 видів, розділених на 7 типів (гілка, що дозволяє класифікувати живі види).

Дуже конкретні організації

Кишкова мікробіота дуже різноманітна, оскільки, за підрахунками, існує кілька сотень видів, що входять до її складу, проте з домінуючим типом, таким як Firmicutes і Bacteroidetes, які становлять найбільший басейн кишкової мікробіоти 1. Його доповнюють актинобактерії, протеобактерії, веррукомікробія, фузобактерії та ціанобактерії. Фірмікути в основному складаються з видів, що належать до клостридій групи XIVa та IV (Ruminococcus та Faecalibacterium prausnitzii), тоді як Bacteroidetes представлені Bacteroides fragilis, Bacteroides ovatus або Bacteroides caccae. Інші субдомінантні види (ентерококи, лактобактерії, стрептококи) або перехідні (дріжджі тощо) доповнюють фауну мікробіоти 2,3. Цей склад варіюється залежно від віку, раціону та стану здоров’я людини, але дозріває приблизно у віці двох-трьох років. Будь-яка зміна його складу призводить до порушення обміну речовин, імунітету або травлення у відповідної людини 4 .

Джерела
1. Цинь та ін. Каталог генних мікробних генів кишечника людини, створений шляхом метагеномного секвенування, Nature, 2010; 464 (7285): 59-65. http://www.nature.com/nature/journal/v464/n7285/full/nature08821.html
2. Чен Дж. Та ін. Внесок кишкової мікробіоти в
здоров’я людини: від народження до 100 років. Curr Top Microbiol Immunol 2013; 358: 323-346. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22094893
3. Lay C et al. Підписи товстої мікробіоти у п’яти країнах північної Європи. Appl Environment Microbiol 2005; 71: 4153-5.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16000838
4. Чербуй та ін. Кишкова мікробіота: компонент здоров’я, який змінюється з віком. Агрономічні інновації, 2013; 33 37-46 https://www6.inra.fr/ciag/content/download/5203/40683/file/Vol33-4-Cherbuy.pdf

Додаткові джерела
- Файл INSERM http://www.inserm.fr/thematiques/physiopathologie-metabolisme-nutrition/dossiers-d-information/microbiote-intestinal-et-sante
- Стаття CNRS https://lejournal.cnrs.fr/articles/microbiote-des-bacteries-qui-nous-vivent-du-bien

Еволюція

Хоча дослідники знали про існування мікробіоти вже давно, лише нещодавно вона стала предметом успішних геномних досліджень.

У кишечнику, не підозрюючи, живуть 100 000 мільярдів бактерій різних видів, а також грибків, дріжджів та вірусів. Деякі дослідники сходяться на думці, що самі по собі вони навіть утворюють певний орган вагою 2 кг, важчий за мозок і такий же складний. Хоча ми знаємо про їх існування більше століття, їх дослідження залишаються відносно недавніми. Оскільки протягом дуже тривалого часу єдиним способом їх характеристики було вирощування їх in vitro та вивчення їх біологічних властивостей, коли лише невелика кількість з них було легко обробляти в лабораторії. Але зараз в межах їх геному дослідники відстежують кожну їх таємницю, особливо завдяки засобам, які використовуються високопродуктивним секвенуванням та метагеномікою, які вивчають їх in situ.

Відомий на кінці ДНК

Таким чином, ідентифікація цих бактерій продовжує прогресувати, і їх особливості все частіше вимірюються за допомогою їх геному. На сьогодні програма міжнародного консорціуму MetaHIT 1, очолюваного INRA, дозволила геномно ідентифікувати майже 800 видів бактерій. Серед них 85% бактеріальних «нових зразків», про які ми до того часу не знали. Ця ж програма також дозволила послідовно послідувати 238 видів бактерій, які були повністю ідентифіковані генетично. MetaHIT поступово дає можливість скласти генетичну карту мікробіоти кишечника, що врешті-решт дозволить використовувати мікробіоти як діагностичний засіб для виявлення ранніх стадій захворювання 2. А вивчення мікробіоти могло б піти ще далі завдяки метатранскриптоміці 3 та метапротеоміці 4, що вивчаються в даний час, обидві охоплюють продукти транскрипції та трансляції геному бактерій, що забезпечують загальний бактеріальний профіль, включаючи функціональний аналіз.

Джерела
1. http://www.metahit.eu: консорціум об'єднує 13 дослідницьких центрів з 8 країн.
2. Li J та співавт. Інтегрований каталог еталонних генів у мікробіомі кишечника людини. Nat Biotechnol. 2014; 32: 834-41. http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n8/full/nbt.2942.html
3. Turnbaugh PJ та ін. Організмні, генетичні та транскрипційні варіації в глибоко секвенсованих мікробіомах кишок однояйцевих близнюків. PNAS 2010; 107: 7503-8. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20363958
4. Wilmes P, Heintz-Buschart A, Bond PL. Десятиліття метапротеоміки: де ми стоїмо і яке майбутнє. Протеоміка 2015; 15 (20): 3409-17. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26315987

Кишкова мікробіота формується з перших моментів життя під впливом різних факторів і еволюціонує протягом перших років, а потім стабілізується.

Зовнішні впливи

Потім ця мікробіота еволюціонує кількісно та якісно під впливом їжі, гігієнічних умов, будь-яких медикаментозних процедур та навколишнього середовища. Серед добре вивчених факторів грудне вигодовування відіграє важливу роль у створенні мікробіоти, сприятливої для особи, з домінуючою імплантацією роду Bifidobacterium 3 та затримкою колонізації Clostridium та Bacteroides порівняно зі штучним молочним кормом. З іншого боку, було показано, що рання антибіотикотерапія 4,5 була фактором, що негативно впливав на її розвиток (подальша поява алергії, астми, діабету, зайвої ваги тощо). Після імплантації мікробіоти вона поступово еволюціонує до диверсифікації залежно від середовища, на яку схильна дитина, та її раціону, стабілізуючись приблизно у віці 3 6 років. Однак воно залишається чутливим протягом усього життя до багатьох факторів, властивих організму (генетика, циркадний ритм) або навколишнього середовища (роль їжі), або навіть до періодів стресу під час лікування антибіотиками, що призводять до дисбіозу.