Швидкі доступні комплекти вірусного контролю для налаштувань нижнього середнього; Новини-Медичні

Застереження: Ця сторінка є автоматичним перекладом цієї сторінки спочатку англійською мовою. Зверніть увагу, оскільки переклади створюються машинно, не всі переклади будуть ідеальними. Цей веб-сайт та його веб-сторінки призначені для читання англійською мовою. Будь-який переклад цього веб-сайту та його веб-сторінок може бути неточним і неточним, повністю або частково. Цей переклад подано на практиці.

Нова стаття, опублікована на сервері попереднього друку bioRxiv *, у квітні 2020 року фіксує дешеву, чутливу та швидку RT-PCR, що підтверджує необхідність виявлення COVID-19. У разі валідації це може забезпечити значний поштовх для діагностичного тестування в регіонах нижчої середньої частини світу.

Оскільки новий коронавірус продовжує набирати шокуючих показників як у розвинених, так і в країнах, що розвиваються, вчені намагаються знайти нові і кращі способи виявлення тих, хто постраждав від коронавірусу 2 (SARS-CoV-2), симптоматичний та безсимптомний важкий гострий респіраторний синдром, а також для лікування пацієнтів з потенційно важкими інфекціями.

В даний час золотим стандартним тестом на виявлення вірусів є кількісний аналіз ланцюгової реакції полімеразної зворотної транскрипції (RIGHT-qPCR). Ця технологія є найбільш точною серед різних підходів управління. Однак, як виконується в даний час, він має серйозний недолік, пов’язаний із використанням високоякісного матеріалу, який використовується для ізоляції нуклеїнової кислоти та термоциклів ПЛР у реальному часі. Вони роблять його недосяжним саме в тих областях, які це найбільше потребують через високі швидкості передачі.

Багато країн із нижчим та середнім рівнем доходу не оснащені засобами для цього типу швидкого та надійного моніторингу, що дозволяє багато випадків залишати недіагностованими, збільшуючи ймовірність високих показників передачі від громади.

Використання недорогих технологій для отримання точних результатів

Поточне дослідження спрямоване на впровадження інноваційної заміни старого методу перенесення реакційних трубок через серію водяних ванн. Натомість дослідники використовували лише дві ванни, які були переробленими пластиковими контейнерами, призначеними для зберігання продуктів, оснащеними вакуумними нагрівальними нагрівачами.

Ці нагрівачі можуть нагрівати воду до 99 градусів Цельсія, яка денатурує нуклеїнову кислоту та амплікони.

Перевагою цієї установки є простота та зручність використання в поєднанні з можливістю точно встановлювати температуру, зберігаючи при цьому циркуляцію тепла. Дослідники використовували Raspberry-Pi для розробки способів налаштування моторизованої зброї, яка переводить реакційні трубки між ваннами.

Різниця у вартості помітна: поточний пристрій коштує випуск у кілька сотень доларів, на відміну від тисяч доларів, необхідних для звичайних ПЛР-термоциклів.

Збільшення швидкості без шкоди для надійності

Є й інші помітні переваги: поточний пристрій може обробити максимум 96 зразків за один крок, і робить це дуже швидко, виконуючи 40 циклів на основі зонда TaqMan за півгодини. Для цього використовується наявні поліпропіленові ПЛР-пробірки.

Якщо лабораторія бажає, тонкими плівковими пробірками з реакцією ПЛР, такими як Cepheid SmartCycler або скляними капілярними пробірками, можна скоротити час до 12 хвилин. Це включає 10 хвилин для PCA та лише 2 хвилини праворуч.

Щоб перевірити цей підхід, дослідники використовували зразки, які були інактивовані або не оброблені, додаючи їх безпосередньо до основних покрокових сумішей RT-PCR, які не вимагають вилучення l'РНК. Крім того, вони запропонували операцію швидкого вилучення, для виготовлення шаблонів РНК потрібно лише 3 хвилини за допомогою магнітних частинок.

Якими були результати дослідження ?

Потужність на сьогоднішній день перевершує більшість настільних теплових велосипедів. По-перше, експеримент підтвердив здатність вакуумних нагрівачів підтримувати температуру водяної бані при температурі від 60 ° C до 97 ° C протягом 30 хв або більше, з варіацією лише 0, 1 ° C і 2 ° C відповідно. На великій висоті потрібні відповідні налаштування часу та температури.

Відносне вірусне навантаження кожного зразка було попередньо визначено за допомогою комерційних систем RT-PCR. Час реакції становив 1 годину 22 хвилини. Неопрацьовані зразки середовища та витягнуті зразки РНК дають відповідні якісні результати ПЛР.

Використовуючи позитивні клінічні зразки COVID-19, вчені показали, що всього за 12 хвилин зразки виявляли підвищену флуоресценцію, коли використовували тонкостінні пробірки, і протягом 26 хвилин із звичайними пробірками. ACP.

Після визначення з і без термоінактивації до 95 ° C 10 хв, але пропускаючи операцію вилучення РНК, перше дало чудові результати.

Нарешті, вони застосували швидку (3 хвилини операцію вилучення РНК), використовуючи техніку на основі магнітних частинок. Це показало 100% чутливість за 12 хв пробігу.

Що висновки означають для управління COVID-19 ?

Дослідники кажуть, що їх технічні характеристики пропонують використовувати методику RT-PCR на основі водяної ванни, яка дозволяє завершити реакцію за 12 хвилин. Коли проводиться екстракція РНК мінімум 3, це забезпечує 100% чутливість: для зразків, підданих необробленій термічній обробці, 90%; а з необробленими зразками - лише 70%. Екстракція РНК посилить потужність при менших вірусних навантаженнях або необроблених зразках.

Потенційним недоліком є споживання більших обсягів деяких реагентів та більш тривалий період, якщо використовуються звичайні пробірки для ПЛР. Тим не менше, дослідники підсумовують: "Це дозволило б сайту без доступу до термоциклерів ПЛР у реальному часі або навіть базових теплових циклів проводити високочутливі та специфічні аналізи золотого стандарту RT-PCR для COVID-19. Це може закрити цикл і дозволити країнам, що розвиваються, посилити свої режими контролю, тим самим визначивши населення, яке буде ізольованим, щоб уникнути масових темпів розповсюдження вірусів, які потенційно можуть перевершити їхні гірші системи охорони здоров'я.

Важливе повідомлення

bioRxiv публікує попередні наукові висловлювання, які не спостерігаються в парі і, отже, не можуть вважатися переконливими, керувати клінічною практикою/поведінкою, пов’язаною зі здоров’ям, або розглядати як визначену інформацію.

Арумугам, А. та ін. (2020). Швидкий аналіз виявлення COVID-19 RT-PCR для параметрів низьких ресурсів. препринт bioRxiv. doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.29.069591. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.29.069591v1

Доктор Ліджі Томас

Доктор Ліджі Томас - лікар-гінеколог, який закінчив Урядовий медичний коледж Університету Калікута, штат Керала, в 2001 році. Лідзі кілька років після закінчення навчання працювала штатним консультантом з акушерства/гінекології в приватній лікарні. . Вона консультувала сотні пацієнтів, які стикаються з проблемами, пов'язаними з вагітністю та безпліддям, і відповідала за понад 2000 пологів, намагаючись завжди досягти нормальних пологів, а не оперативних.

Цитати

Будь ласка, використовуйте один із наступних форматів, щоб цитувати цю статтю у своєму есе, роботі чи доповіді:

Томас, Лідзі. (2020, 04 травня). Швидкі доступні набори вірусного контролю для налаштувань нижнього середнього. Новини-Медичні. Отримано 28 січня 2021 року з https://www.news-medical.net/news/20200504/Rapid-affensible-virus-testing-kits-for-low-resource-settings.aspx.

Томас, Лідзі. "Швидкі доступні набори вірусного контролю для налаштувань нижчого середнього". Новини-Медичні. 28 січня 2021 року. .

Томас, Лідзі. "Швидкі доступні набори вірусного контролю для налаштувань нижчого середнього". Новини-Медичні. https://www.news-medical.net/news/20200504/Rapid-affensible-virus-testing-kits-for-low-resource-settings.aspx. (дата звернення 28 січня 2021 р.).

Томас, Лідзі. 2020. Швидкі доступні набори вірусного контролю для налаштувань нижчого середнього. News-Medical, переглянуто 28 січня 2021 року, https://www.news-medical.net/news/20200504/Rapid-affensible-viral-testing-kits-for-low-resource-settings.aspx.

News-Medical.Net надає цю медичну інформаційну послугу відповідно до цих умов. Зверніть увагу, що медична інформація, розміщена на цьому веб-сайті, призначена для підтримки, а не для заміщення стосунків між пацієнтом та лікарем/лікарем та медичної консультації, яку вони можуть надати.

News-Medical.net - Сайт AZoNetwork