Таємне походження ВІЛ
Автор: Богдан Бішок/Дата публікації: 12.01.2015 14:12
Вірус імунодефіциту людини (ВІЛ) та спричинене ним захворювання, синдром набутого імунодефіциту (СНІД - від французької абревіатури, Syndrome d \\\ 'Immuno-Deficience Acquis), здавалося, раптово з’явився, коли вони були виявлені лікарями, але з того часу генетика уточнила, коли і де вірус вперше потрапив до людей.
Легко зрозуміти, чому СНІД здавався таким таємничим і лякаючим, коли американські лікарі вперше виявили його 35 років тому. Ця хвороба позбавляє молодих і здорових людей сильної імунної системи, роблячи їх слабкими та вразливими. І це ніби вийшло несподівано, пише ВВС.
Сьогодні ми знаємо більше про те, як і чому ВІЛ - вірус, що призводить до СНІДу - став глобальною пандемією. Не дивно, що працівники секс-бізнесу ненавмисно зіграли свою роль у розповсюдженні хвороби. Але не менш важливими були ролі торгівлі, краху колоніалізму та соціально-політичної реформи ХХ століття.
Звичайно, ВІЛ з’явився несподівано. Ймовірно, це почалося як вірус, який вражає різні види мавп у західно-центральній Африці. Потім воно потрапило до людей у декількох випадках, ймовірно, в результаті вживання м’яса із зараженої дикої природи. Деякі люди носили штам ВІЛ, дуже близький до того, що спостерігається, наприклад, у чорних мавп мангабі. Але вірус ВІЛ від мавп не став глобальною проблемою. Люди більше схожі на горил та шимпанзе, ніж інші види мавп. Але навіть коли ВІЛ поширився на людей від цих великих мавп, це не обов'язково перетворилося на широкомасштабну проблему здоров'я.
ВІЛ від мавп зазвичай належить до типу вірусу, який називається ВІЛ-1. Один з них називається ВІЛ-1 групи О, і випадки зараження людей в основному обмежені Західною Африкою.
Насправді лише одна форма ВІЛ поширилася після того, як вона поширилася на людину. Цей штам, який, ймовірно, походить від шимпанзе, називається ВІЛ-1 групи М (для "основного"). Понад 90% ВІЛ-інфекцій належать до групи М. Що викликає очевидне запитання: що такого особливого у цій групі М ВІЛ-1?
Дослідження, опубліковане в 2014 році, пропонує дивовижну відповідь: у цій групі М. може бути нічого особливо особливого. Вона не є особливо інфекційною, як можна було б очікувати. Натомість, здається, що ця форма ВІЛ просто використовує переваги подій. "Екологічні, а не еволюційні фактори призвели до його швидкого розповсюдження", - говорить Нуно Фарія з Оксфордського університету у Великобританії.
Фарія та його колеги створили генеалогічне дерево ВІЛ, проаналізувавши різноманітний спектр генів ВІЛ, зібраних від близько 800 інфікованих людей у Центральній Африці.
Гени зазнають нових мутацій з досить постійною швидкістю, так що дві геномні послідовності можна порівняти, підрахувавши відмінності, які можна розвинути, коли вони мають спільного предка. Ця техніка широко використовується, наприклад, для встановлення того, що наш загальний предок шимпанзе жив щонайменше 7 мільйонів років тому.
"Віруси РНК (рибонуклеїнової кислоти), такі як ВІЛ, еволюціонують приблизно в 1 мільйон разів швидше, ніж ДНК людини", - говорить Фарія. Це означає, що „молекулярний годинник” ВІЛ справді дуже швидко тикає. Настільки швидко, що Фарія та її колеги виявили, що всі геноми ВІЛ мають спільного предка, який існував не більше 100 років тому. Форма ВІЛ-1 М, ймовірно, датується 1920-м рр. Дослідники пішли далі. Оскільки вони знали, де було зібрано кожен із зразків ВІЛ, вони змогли встановити походження пандемії в конкретному місті: Кіншасі, нині столиці Демократичної Республіки Конго.
Потім вчені звернулися до історичних записів, щоб з’ясувати, чому ВІЛ-інфекція в африканському місті в 20-х роках могла з часом призвести до пандемії. Швидка послідовність подій швидко виявилася.
У 20-х роках ДР Конго був бельгійською колонією, а Кіншасу - тоді відому як Леопольдвіль - щойно називали столицею. Місто стало дуже привабливим напрямком для молодих робітників, котрі прагнуть розбагатіти, та для секс-працівників, які дуже готові допомогти їм витратити свої заробітки. Вірус швидко поширився серед населення. І це не обмежувалось цим містом. Дослідники виявили, що в 1920 р. Це було одне з найбільш сполучених міст Африки. Користуючись повною мірою розгалуженою залізничною мережею, якою щороку користуються сотні тисяч людей, вірус поширився всього за 20 років у містах, розташованих за 1500 кілометрів. У 60-х роках існували всі умови для вибуху рівня зараження.
Початок цього десятиліття приніс чергові зміни. Конго здобуло незалежність від Бельгії і стало привабливим джерелом франкомовної робочої сили в інших частинах світу, включаючи Гаїті. Коли через кілька років ці молоді гаїтяни повернулися додому, вони перенесли певну форму групи М ВІЛ-1, яка називається «підтип В», у західну Атлантику.
Ця форма ВІЛ досягла Сполучених Штатів у 1970-х роках, коли сексуальне звільнення та вороже ставлення до гомосексуалізму призвели до концентрації геїв у космополітичних містах, таких як Нью-Йорк та Сан-Франциско. Знову ВІЛ скористався соціально-політичною ситуацією, щоб швидко поширитися в США та Європі.
"Немає підстав вважати, що інші підтипи не поширились би так швидко, як підтип B, з огляду на подібні екологічні обставини", - говорить Фарія. Але історія поширення вірусу ВІЛ ще не закінчена.
Наприклад, у 2015 році в американському штаті Індіана спалахнув спалах, пов’язаний з ін’єкцією наркотиків. Американські центри з контролю та профілактики захворювань аналізують послідовності геному ВІЛ та дані місця зараження. `` Ці дані допомагають нам зрозуміти масштаби епідемії і допоможуть зрозуміти, коли працюють заходи з охорони здоров'я.
Цей підхід також може застосовуватися для інших патогенів. У 2014 році Йонатан Град з Гарвардської школи громадського здоров’я в Бостоні, штат Массачусетс, та його колега Марк Ліпсіч опублікували результати опитування щодо поширення лікарсько-стійкої гонореї в США.
"Оскільки ми мали представницькі послідовності людей у різних містах у різний час та з різною сексуальною орієнтацією, ми можемо показати, що поширення було із заходу країни на схід", - говорить Ліпсіч.
Крім того, вони можуть підтвердити, що лікарсько-стійка форма гонореї, як видається, циркулювала переважно у чоловіків-геїв. Це може призвести до моніторингу цих груп ризику з метою подальшого зменшення поширення хвороби.