ТЕСТОВАНІ набори для випробування мікробіомів - MyMicrobiome

Принаймні з часів "Gut mit Charme" ми знаємо, що кишечник є центром нашого здоров'я та добробуту. Довго нехтувані дослідження зосереджувались на кишечнику та його співмешканцях, нашому мікробіомі, протягом добрих 10 років. Поряд з цим вчені усього світу каталогізують мікробіоми нашої шкіри, рота, легенів, сечостатевих шляхів і, перш за все, нашого кишечника. Таким чином, вони намагаються з’ясувати, які мікробні склади в окремих регіонах тіла є здоровим, збалансованим мікробіомом, або дізнатися, як найкраще відновити цей баланс, коли порушуються мікробіологічні екосистеми в нас і всередині.

Набори для випробування мікробіомів з’явилися як гриби у всьому світі

Паралельно з науковою працею в усьому світі, як гриби, з’являються набори для випробування мікробіомів, доступні широкому загалу. Що роблять ці тести? Які тести існують і чим вони відрізняються? MyMicrobiome розглянув мікробіомічні тести, доступні на ринку.

Ми просили більше десяти постачальників про самотестування, включаючи uBiome, Viome, Biohm, Ihcode та DayTwo. Загалом п'ять погодились взяти участь, і ми детальніше розглянули їх:

Biomes.world(Німеччина)
Процвітати(СПОЛУЧЕНІ ШТАТИ)
Атлас Біомед(Великобританія)
ТФТАК(Естонія)
Medivere(Німеччина)

Ми тестували кожен набір двічі, до і після споживання пробіотичного йогурту щодня протягом двох тижнів.

Оцінка тестованих наборів для випробування мікробіомів за різними критеріями

Доставка/упаковка/інструкція/повернення

Загалом, всі комплекти були доставлені швидко (протягом тижня). Тільки товар із США застряг на митниці. Всі набори були добре упаковані в коробку, за винятком набору від TFTAK, упаковка все ще знаходиться в розробці. За змістом набори від Biomes, Thryve та TFTAK були дуже схожими. Там був тампон, невелика пробірка зі стабілізуючою рідиною для зразка та інструкція для взяття зразка. Трубка для відбору проб Атласу була трохи більшою, і потрібно було більше зразка. Medivere не мав стабілізуючої рідини в пробірці, і потрібно було близько 25 мл зразка, тому тут менше точок. TFTAK, Medivere та Atlas також надіслали уловлювачі табуретів, TFTAK і Thryve отримали комплект для заміни на випадок, якщо щось піде не так.

Найпростіший спосіб повернення зразків був за допомогою Atlas, Biomes та Medivere, оскільки на борту були конверт або упаковка з поштовою оплатою. Був встановлений ящик для повернення комплекту Thryve, але витрати на поштову оплату спочатку повинні нести ви самі. Коли квитанція буде надіслана, сума буде повернена через PayPal. Оскільки TFTAK не має жодної упаковки, не було ні конверта, ні поштової оплати, але це, безумовно, зміниться, як тільки коробка для упаковки буде розроблена.

На результати довелося чекати від 2 тижнів до 3 місяців, результати від TFTAK прийшли останніми.

Результати були або представлені на так званій інформаційній панелі (Thryve, Biomes, Atlas) або узагальнені у звіті (Biomes, Medivere, TFTAK). Ви ввійшли в інформаційну панель і маєте лише огляд, з якого ви можете отримати доступ до різних областей. Ця інформаційна панель була розроблена більш-менш чітко. Biomes і Thryve полегшили перегляд, з Атласом у мене часто виникали проблеми з пошуком потрібних даних, деякі речі були дуже прихованими.

Інформаційні панелі постачальника

Загалом, на інформаційних панелях можна знайти більше інформації, ніж у звіті, лише вам потрібно багато шукати та переглядати. Ще однією перевагою приладових панелей є те, що ви можете детально переглядати свої бактерії, одним клацанням пояснюється додаткова інформація про відповідну бактерію.

Звіти від Biomes, Medivere та TFTAK були дуже добре розроблені та дають дуже хороший огляд усього. Medivere поділив аналізовані бактерії на функціональні групи та дав список знайдених бактеріальних доменів.

Biomes узагальнює дані інформаційної панелі на новій панелі інструментів (з середини листопада 2018 р.) Та надає рецепти, пристосовані до досліджуваного мікробіома.

TFTAK перерахував найпоширеніші бактерії в досліджуваній пробі з їх властивостями, у додатковій таблиці найпоширеніші бактерії у здоровій порівняльній популяції (тут з Естонії) порівнювали із наявністю у досліджуваній пробі.

Результати різних аналізів були дуже різноманітними.

Усі аналізи надавали інформацію про різноманітність мікробіомів, поради щодо здоров’я та харчування. Biomes та Medivere засвідчили дуже велику різноманітність тестованого мікробіома, тоді як різноманітність в інших трьох тестах була гіршою. Однак за два тижні йогуртової дієти різноманітність зросла. Чим вище сорт, тим краще для вашого здоров’я.

Інфобокс: Ентеротипи

Залежно від того, які бактеріальні групи домінують у вашому мікробіомі, можлива класифікація на один з 3 ентеротипів, які пов’язані з вашим харчуванням:

У цьому мікробіомі переважають бактероїди, де вони складають в середньому до 80% бактеріальної екосистеми. Це означає, що різноманітність мікробіома страждає від цього домінування. Ці бактерії харчуються простими цукрами, тваринними жирами та білками.

У цьому типі мікробіомів переважають превотелли, які, як правило, ізольовані від корінних племен Амазонки та Африки. Ваш раціон складається здебільшого з рослинної клітковини і дуже мало або зовсім не містить цукру, м’яса або жиру. В Європі цей ентеротип переважно спостерігається у вегетаріанців.

Групу бактерій, що домінує в цьому ентеротипі, очолює румінокок, за нею - евбактерії, дорея та інші. Ця група бактерій особливо добре виробляє масляну кислоту, коротколанцюгову жирну кислоту з протизапальними властивостями. Ця група в основному використовує вуглеводи, такі як стійкий крохмаль і целюлоза (із сочевиці, квасолі або цільних зерен).

Не кожен продукт містив інформацію про ентеротип

Хоча Thryve та TFTAK не надали жодної інформації про ентеротип, результати від Biomes були збіжними з результатами Atlas. Medivere пише, що в обох тестах ми мали ентеротип 3, тоді як результати показують ентеротип 1, тобто домінування бактероїдів.

Іншим цікавим результатом є співвідношення бактеріальних доменів Firmicutes до Bacteroidetes. Тверді речовини особливо добре використовують жири, тому, якщо у вас високий коефіцієнт твердих речовин/бактероїдетів, ви, як правило, швидше набираєте вагу. Співвідношення в ідеалі повинно бути від 1 до 3. За словами Біомеса, наш перевірений мікробіом, як правило, споживає дуже багато калорій, тоді як в інших тестах ми оптимальніші. Atlas та TFTAK не надали жодної інформації щодо співвідношення твердих речовин/бактеріоїдів.

Загалом результати різних тестів були дуже різними.

Всі випробування проводились з одним і тим же зразком, але вже були очевидні відмінності в кількості необхідної проби та в типі збереження зразка. Для Biomes, Thryve та TFTAK було достатньо мазка з туалетного паперу, тоді як Atlas вимагає приблизно 2 мл, а Medivere - навіть 25 мл зразка. Всі тести, за винятком Medivere, мали стабілізуючий розчин у пробірці для зразків. Це необхідно для того, щоб, з одного боку, бактерії не розмножувались по дорозі до лабораторії, а з іншого боку, бактеріальна ДНК і РНК, які досліджуються в лабораторії, стабілізувались. Тип розчину для стабілізації може вплинути на результати.

У всіх випадках мікробіом аналізували за допомогою аналізу рРНК 16s, загального методу, який лише частково опускається до рівня бактеріальних видів. Оскільки кожна бактерія має різну кількість копій 16РРНК, для визначення фактичної кількості бактерій у зразку необхідно використовувати правильний алгоритм. Тут теж можна дійти до різних результатів. Зрештою, це також залежить від того, з якою базою даних порівнюються результати. В даний час кожен виробник має власну базу даних, яка є більш-менш обширною, переважно регіональною. Отримані результати завжди порівнюються із спільнотою, і, залежно від ситуації, значення збільшуються або зменшуються при порівнянні. Тому доцільно вибрати виробника, який базується, якщо це можливо, в одній країні або принаймні на одному континенті. Середній мікробіом європейського населення відрізняється, наприклад Б. дуже відрізняється від північноамериканських або азіатських.

Незважаючи на різницю в результатах, більшість аналізів показали схожі тенденції у складі мікробіома.

У першому тесті досліджуваний відповідав ентеротипу 2, а в другому тесті - ентеротипу 3 (Biomes, TFTAK та Atlas). Ці два ентеротипи дуже добре поєднуються з дієтою досліджуваного.

У 3 з 5 тестів (Biomes, TFTAK та Medivere) частка прозапальних бактерій (протеобактерій) була збільшена.

Бактеріальне різноманіття покращувалось або залишалося однаково хорошим у всіх тестах з першого по другий час тесту.

Всі аналізи дають вказівки на можливі захворювання

Під час усіх аналізів я отримую вказівку на можливі захворювання, які можуть виникнути конкретно через дисбаланс аналізованого мікробіома.

Резюме

Наука про мікробіом людини ще дуже зароджена. Тим не менше, вже є багато чітких доказів того, як наш мікробіом може впливати на наше здоров'я. Результати різних тестів різняться залежно від різних методів та баз даних, які використовуються, але можна визнати тенденції, які проходять усі тести. Важко сказати, який із тестів має найкращий метод аналізу. Людям, які відчувають, що зі здоров’ям кишечника щось не так, або тим, хто просто хоче знати, як вони можуть зробити щось корисне для свого здоров’я, такий тест на мікробіоми, безумовно, корисний.

Проте зроблений висновок, і це також було показано в кожному тесті, що дієта з низьким вмістом білка і жиру і багатою рослинами збільшує біорізноманіття нашого мікробіома. Однак це не означає, що слід повністю уникати білків і жирів, але, як ми всі знаємо, їжа повинна бути якомога необробленою, свіжою та барвистою. Чим різноманітніше харчування, тим більша різноманітність нашого мікробіома.

Я впевнений, що тести стануть кращими та надійнішими з подальшим розвитком технічних можливостей та подальшими дослідженнями мікробіому. Однак загальноприйнятні стандарти для аналізу мікробіомів та відбору проб терміново потрібні для отримання відповідних результатів!

Тому ми також будемо проводити тести через регулярні проміжки часу та тримати вас у курсі.